BEGIN:VCALENDAR VERSION:2.0 PRODID:-//mb-1.laga.fr//NONSGML kigkonsult.se iCalcreator 2.20.2// METHOD:PUBLISH X-WR-CALNAME:mb X-WR-CALDESC:Description X-WR-TIMEZONE:Europe/Paris BEGIN:VEVENT UID:20230626T154010CEST-5029luFWWe@mb-1.laga.fr DTSTAMP:20230626T134010Z CATEGORIES:SEMINAIRE MB DESCRIPTION:Saoussen Latrach\n DTSTART:20230512T140000 DTEND:20230512T150000 LOCATION:Salle B405\, bâtiment B\, LAGA\, Institut Galilée\, Université Par is 13GGé SUMMARY:Mathematical study of the spread and blockage of an inflammatory di sease END:VEVENT BEGIN:VEVENT UID:20230626T154010CEST-5035edvIAv@mb-1.laga.fr DTSTAMP:20230626T134010Z CATEGORIES:SEMINAIRE MB DESCRIPTION:Thanh Mai Pham Ngoc\n The first scheme considers the observatio n of cell evolution up to a certain time T and we obtain the whole tree of divisions. The second observational scheme takes into account the case wh ere the division tree is no longer completely observed. The division kerne l then depends on the density of the observations\, itself a solution of a growth fragmentation PDE. We will apply non-parametric statistical techni ques in connection with the solution of inverse problems in order to estim ate the kernel of divisions in both contexts and we will study the theoret ical properties of the proposed estimators. DTSTART:20230512T130000 DTEND:20230512T140000 LOCATION:Salle B405\, bâtiment B\, LAGA\, Institut Galilée\, Université Par is 13GGé SUMMARY:Nonparametric estimation for size-structured population of cells. END:VEVENT BEGIN:VEVENT UID:20230626T154010CEST-5228nWp8Es@mb-1.laga.fr DTSTAMP:20230626T134010Z CATEGORIES:SEMINAIRE MB DESCRIPTION:Jean-Marie Mirebeau\n Dans cet exposé je présenterai des méthod es numériques de résolution de variantes de l'équation eikonale\, permetta nt de calculer les chemins minimisant globalement certaines mesures de lon gueur. L'approche\, motivée par des applications en segmentation\, est ass ez souple pour permettre l'introduction d'anisotropie\, d'une pénalisation de la courbure des chemins\, ou encore pour forcer ceux-ci à tourner touj ours du même côté. \n DTSTART:20230324T140000 DTEND:20230324T150000 LOCATION:Salle B405\, bâtiment B\, LAGA\, Institut Galilée\, Université Par is 13GGé SUMMARY:Calcul de chemins minimaux\, et application à la segmentation d'ima ges. END:VEVENT BEGIN:VEVENT UID:20230626T154010CEST-5312nbXFkO@mb-1.laga.fr DTSTAMP:20230626T134010Z CATEGORIES:SEMINAIRE MB DESCRIPTION:Élie Cerf\n DTSTART:20230310T140000 DTEND:20230310T150000 LOCATION:Salle B405\, bâtiment B\, LAGA\, Institut Galilée\, Université Par is 13GGé SUMMARY:Modélisation probabiliste de maladie génétique basée sur un grand n ombre de gènes END:VEVENT BEGIN:VEVENT UID:20230626T154010CEST-5337i5DbPH@mb-1.laga.fr DTSTAMP:20230626T134010Z CATEGORIES:SEMINAIRE MB DESCRIPTION:Frédérique Noël\n DTSTART:20230306T120000 DTEND:20230306T130000 LOCATION:Salle B405\, bâtiment B\, LAGA\, Institut Galilée\, Université Par is 13GGé SUMMARY:Optimisation de la ventilation pulmonaire chez l'humain et chez tou s les mammifères. END:VEVENT BEGIN:VEVENT UID:20230626T154010CEST-5375vkf1SI@mb-1.laga.fr DTSTAMP:20230626T134010Z CATEGORIES:SEMINAIRE MB DESCRIPTION:Gautier Stoll \n \n \n \n\n\nI will present a suite of softwar e tools that can efficiently model\nsignaling pathways in various biologic al contexts (eg cancer\, immune\nresponse). It is based on Boolean activit y of genes/proteins within continuous time Markov chain(s). \n\nAfter a sh ort introduction of\nsignaling pathways in cancer/immune response\, I will present the\ndifferent modeling tools with concrete applications in biolo gy.Sites web:https://www.crcordeliers.fr/equipes/metabolisme-cancer-et-imm unite/ http://www.kroemerlab.com/ \n\n&\;lt\;style type="\;text/css& quot\;&\;gt\;p { margin-bottom: 0.25cm\; direction: ltr\; color: #00000 0\; line-height: 115%\; text-align: left\; orphans: 2\; widows: 2\; backgr ound: transparent }p.western { font-family: "\;Liberation Serif"\; \, serif\; font-size: 12pt\; so-language: en-US }p.cjk { font-family: &quo t\;Noto Serif CJK SC"\;\; font-size: 12pt\; so-language: zh-CN }p.ctl { font-family: "\;Lohit Devanagari"\;\; font-size: 12pt\; so-langu age: hi-IN }&\;lt\;/style&\;gt\; DTSTART:20230217T140000 DTEND:20230217T150000 LOCATION:Salle B405\, bâtiment B\, LAGA\, Institut Galilée\, Université Par is 13GGé SUMMARY:MaBoSS tool suite for modeling signaling pathways in biology END:VEVENT BEGIN:VEVENT UID:20230626T154010CEST-5419Kbrvu5@mb-1.laga.fr DTSTAMP:20230626T134010Z CATEGORIES:SEMINAIRE MB DESCRIPTION:Tabea Rebafka\n We present results of our method obtained for a collection of foodwebs in ecology. We illustrate that the method provides relevant clusterings and that the estimated model parameters are highly i nterpretable and useful in practice.\n DTSTART:20230210T140000 DTEND:20230210T150000 LOCATION:Salle B405\, bâtiment B\, LAGA\, Institut Galilée\, Université Par is 13GGé SUMMARY:Model-based graph clustering with an application to ecological netw orks END:VEVENT BEGIN:VEVENT UID:20230626T154010CEST-5481gxljUH@mb-1.laga.fr DTSTAMP:20230626T134010Z CATEGORIES:SEMINAIRE MB DESCRIPTION:Felix Cheysson\n DTSTART:20230127T140000 DTEND:20230127T150000 LOCATION:Salle B405\, bâtiment B\, LAGA\, Institut Galilée\, Université Par is 13GGé SUMMARY:Some $\alpha$-mixing properties for Hawkes processes and applicatio ns to inference END:VEVENT BEGIN:VEVENT UID:20230626T154010CEST-5535wCb2O6@mb-1.laga.fr DTSTAMP:20230626T134010Z CATEGORIES:SEMINAIRE MB DESCRIPTION:NGUYEN Thi Quynh Nga\n DTSTART:20230120T140000 DTEND:20230120T150000 LOCATION:Salle B405\, bâtiment B\, LAGA\, Institut Galilée\, Université Par is 13GGé SUMMARY:A control strategy for the Sterile Insect Technique to avoid the ha ir-trigger effect END:VEVENT BEGIN:VEVENT UID:20230626T154010CEST-56081IwpDW@mb-1.laga.fr DTSTAMP:20230626T134010Z CATEGORIES:SEMINAIRE MB DESCRIPTION:Nguyen Tan Sy\n DTSTART:20221216T140000 DTEND:20221216T150000 LOCATION:Salle B405\, bâtiment B\, LAGA\, Institut Galilée\, Université Par is 13GGé SUMMARY:A No-Reference Measure for Uneven Illumination Assessment on Laparo scopic Images END:VEVENT BEGIN:VEVENT UID:20230626T154010CEST-5677Nd6pCu@mb-1.laga.fr DTSTAMP:20230626T134010Z CATEGORIES:SEMINAIRE MB DESCRIPTION:Sébastien Li-Thiao-Té\n Durant la thèse de doctorat\, un étudia nt acquiert des compétences professionnelles : lire un article\, présenter des travaux\, discuter de la portée des résultats\, etc. La plupart du te mps\, cette maturité scientifique s'obtient par l'expérience\, sur le tas\ , et parfois laborieusement. Nous proposons ici 10 règles simples et appli cables pour aider les étudiants à aller plus loin dans leur travail de rec herche.\n DTSTART:20221202T140000 DTEND:20221202T150000 LOCATION:Salle B405\, bâtiment B\, LAGA\, Institut Galilée\, Université Par is 13GGé SUMMARY:Méthodologie de la recherche END:VEVENT BEGIN:VEVENT UID:20230626T154010CEST-5790H5IZIc@mb-1.laga.fr DTSTAMP:20230626T134010Z CATEGORIES:SEMINAIRE MB DESCRIPTION:Thanh Mai Pham Ngoc\n Le premier schéma considère l’observation de l’évolution des cellules jusqu’à un certain temps T et nous obtenons l ’arbre entier des divisions. Le deuxième schéma observationnel prend en co mpte le cas où l’arbre des divisions n’est plus complètement observé. Le n oyau de division dépend alors de la densité des observations\, elle-même s olution d’une EDP de transport fragmentation. Nous appliquerons des techni ques de statistiques non-paramétriques en lien avec la résolution de probl èmes inverses afin d’estimer le noyau de divisions dans les deux contextes et nous nous attacherons à étudier les propriétés théoriques des estimate urs proposés.Il s’agit d’un travail en collaboration avec V. H. Hoang\, V. Rivoirard et V. C. Tran DTSTART:20221118T140000 DTEND:20221118T150000 LOCATION:Salle B405\, bâtiment B\, LAGA\, Institut Galilée\, Université Par is 13GGé SUMMARY:Estimation du noyau de division d’une population structurée par la taille. END:VEVENT BEGIN:VEVENT UID:20230626T154010CEST-6167uIrw8B@mb-1.laga.fr DTSTAMP:20230626T134010Z CATEGORIES:SEMINAIRE MB DESCRIPTION:Magali Ribot\n DTSTART:20220610T110000 DTEND:20220610T120000 LOCATION:Salle B405\, bâtiment B\, LAGA\, Institut Galilée\, Université Par is 13GGé SUMMARY:Modèles de mélange pour la croissance de biofilms END:VEVENT BEGIN:VEVENT UID:20230626T154010CEST-65402aZPWp@mb-1.laga.fr DTSTAMP:20230626T134010Z CATEGORIES:SEMINAIRE MB DESCRIPTION:Luca Alasio\n DTSTART:20220415T110000 DTEND:20220415T120000 LOCATION:mode hybride B405 et lien bbbGGé SUMMARY:Towards a new mathematical model of the visual cycle END:VEVENT BEGIN:VEVENT UID:20230626T154010CEST-6603uWtLJV@mb-1.laga.fr DTSTAMP:20230626T134010Z CATEGORIES:SEMINAIRE MB DESCRIPTION:Matthieu Clertant \n\n \n \n \n \n\nLes\ntrente dernières année s ont vu une implication grandissante des\nstatisticiens dans la mise en p lace du design des phases récoces\nd’essais cliniques en oncologie. Alors \nqu’il est généralement admis que les ancien\net standard design «&\;n bsp\;3+3&\;nbsp\;»\, une nouvelle question se pose\naux cliniciens&\ ;nbsp\;: comment choisir\, parmi les nouvelles\npropositions\, celle ns \n \n\nDon\npropose ermet\nde les regrouper en trois classes. plusétudierss \n \n\nDans\nun second temps\, on s’intéresse à lrelative\nCelle-cid’essais\n cliniques fictifs générés sous un \nscénario&\;nbsp\;le\nscénario est c onstitué\nprobabilité\nde toxicité \nassociées à s.\nCe cadre comparatif i ntroduit par Storer en 1989 \na permis la mise en place des designs modern es\, mais il manque\ndésormais de précision et de rigueur. set\npour les m êmes critèresest\nla meilleuremettra\nen avant l\nméthode BIl\nest possibl eLes\névaluations \nobtenues sont sans bruit\, non-biaisées et reproductib les. Cela\nnécessite de changer notre point de vue en étudiant directement les\nessais cliniques générés\, erécapitulativesaux\nétudes cas-témoins a ppariées ou aux essais cliniques croisés.\n DTSTART:20220408T130000 DTEND:20220408T140000 LOCATION:Horaire inhabituel. Lieu : B405 et lien bbbGGé SUMMARY:Designs en phase précoce d’essais cliniques : principes\, propriét és et performances ? END:VEVENT BEGIN:VEVENT UID:20230626T154010CEST-6679vKbluH@mb-1.laga.fr DTSTAMP:20230626T134010Z CATEGORIES:SEMINAIRE MB DESCRIPTION:Katia Aït Ameur\n On s’intéresse à des modèles aux moments décr ivant la dynamique de brouillards de gouttes. Cette dynamique est représen tée par une fonction de distribution f de gouttes suivant l’équation de Wi lliams Boltzmann. Compte tenu du coût de calcul requis pour la résolution numérique de l’équation de Williams Boltzmann\, on dérive des modèles macr oscopiques basés sur les moments en taille de goutte et en vitesse de la f onction de distribution f. De manière classique\, les modèles aux moments pour les sprays sont faiblement hyperboliques et génèrent des singularités de type ?-choc qui sont difficiles à capturer par les schémas numériques. La difficulté est d’assurer que le vecteur de moments calculé par le sché ma numérique\, appartient à l’espace convexe des moments. Ceci est d’une i mportance majeure car la fonction de distribution f est explicitement reco nstruite à partir des moments. Cette propriété est appelée réalisabilité. Le but ici est de développer des schémas numériques d’ordre élevé en espac e et en temps\, précis\, robustes et préservant les espaces convexes. On c onsidère deux familles de schémas numériques : les schémas volumes finis c inétiques et les schémas Galerkin discontinus d’ordre élevé. Ces schémas g énèrent des oscillations non physiques autour des discontinuités et un moy en d’y remédier est d’utiliser des limiteurs de pente. L’enjeu ici est d’a mortir ces oscillations suffisamment pour assurer la réalisabilité et la s tabilité sans que l’ordre de la méthode numérique ne soit impacté. \n DTSTART:20220325T140000 DTEND:20220325T150000 LOCATION:Salle B405\, bâtiment B\, LAGA\, Institut Galilée\, Université Par is 13GGé SUMMARY:Méthodes numériques d’ordre élevé pour les modèles aux moments END:VEVENT BEGIN:VEVENT UID:20230626T154010CEST-669472Zxg9@mb-1.laga.fr DTSTAMP:20230626T134010Z CATEGORIES:SEMINAIRE MB DESCRIPTION:Caroline Chaux\n Séparation de sources : travail conjoint avec S. Anthoine\, A. Cherni et B. Torrésani dans le cadre du projet bifrostFac torisation de tenseur : travail conjoint avec X. Vu\, N. Thirion-Moreau\, S. Maire&\;nbsp\; DTSTART:20220325T110000 DTEND:20220325T120000 LOCATION:mode hybride B405 et lien bbbGGé SUMMARY:Approches proximales pour la résolution de problèmes inverses END:VEVENT BEGIN:VEVENT UID:20230626T154010CEST-6741MzBwWU@mb-1.laga.fr DTSTAMP:20230626T134010Z CATEGORIES:SEMINAIRE MB DESCRIPTION:Yousri Slaoui\n Dans la première partie\, nous utilisons des al gorithmes stochastiques\, afin de construire des estimateurs récursifs. L' intérêt majeur de ces séquentielle sans être obligé de stoker en mémoire t outes les observations passées.Dans la troisième partie\, nous abordons le problème de la classification supervisée de courbes\, nous soulignons le gain del'utilisation des approches récursives en utilisant des données sim ulées et ensuite des données réelles.\n issu du domaine de la Psychologie plus précisément en électroencéphalographie (EEG) qui souligne l’intérêt p ratique de la DTSTART:20220318T110000 DTEND:20220318T120000 LOCATION:Salle B405\, bâtiment B\, LAGA\, Institut Galilée\, Université Par is 13GGé SUMMARY:Estimation récursive dans la cadre des données fonctionnelles : pré dictions\, classifications et applications END:VEVENT BEGIN:VEVENT UID:20230626T154010CEST-6795EHpmw3@mb-1.laga.fr DTSTAMP:20230626T134010Z CATEGORIES:SEMINAIRE MB DESCRIPTION:Valentin De Bortoli\n \n-arxiv link:&\;nbsp\;https://arxiv.o rg/abs/2106.01357-code:&\;nbsp\;https://github.com/JTT94/diffusion_schr odinger_bridge DTSTART:20220311T110000 DTEND:20220311T120000 LOCATION:Salle B405\, bâtiment B\, LAGA\, Institut Galilée\, Université Par is 13GGé SUMMARY: Diffusion Schrödinger Bridge with Applications to Score-Based Gene rative Modeling END:VEVENT BEGIN:VEVENT UID:20230626T154010CEST-6863vhDZtI@mb-1.laga.fr DTSTAMP:20230626T134010Z CATEGORIES:SEMINAIRE MB DESCRIPTION:Florimond Guéniat\n DTSTART:20220218T110000 DTEND:20220218T120000 LOCATION:Salle B405\, bâtiment B\, LAGA\, Institut Galilée\, Université Par is 13GGé SUMMARY:Analyses Modales\, et Apprentissage par Renforcement Profond en Méc anique des Fluides END:VEVENT BEGIN:VEVENT UID:20230626T154010CEST-6903FV276T@mb-1.laga.fr DTSTAMP:20230626T134010Z CATEGORIES:SEMINAIRE MB DESCRIPTION:Laura Kanzler\n \n DTSTART:20220211T110000 DTEND:20220211T120000 LOCATION:Salle B405\, bâtiment B\, LAGA\, Institut Galilée\, Université Par is 13GGé SUMMARY:Kinetic Modelling of Colonies of Myxobacteria END:VEVENT BEGIN:VEVENT UID:20230626T154010CEST-6964pgUnXM@mb-1.laga.fr DTSTAMP:20230626T134010Z CATEGORIES:SEMINAIRE MB DESCRIPTION:Alexandre Poulain (click here for the video)\n DTSTART:20220204T110000 DTEND:20220204T120000 LOCATION:Salle B405\, bâtiment B\, LAGA\, Institut Galilée\, Université Par is 13GGé SUMMARY:Multi-compartment model of tracer transport in the brain: applicati on to the imaging of cerebral tumors. END:VEVENT BEGIN:VEVENT UID:20230626T154010CEST-7018GBvbtw@mb-1.laga.fr DTSTAMP:20230626T134010Z CATEGORIES:SEMINAIRE MB DESCRIPTION:Édouard Pauwels\n DTSTART:20220121T140000 DTEND:20220121T150000 LOCATION:Séminaire en distancielGGé SUMMARY:Non-smooth algorithmic differentiation END:VEVENT BEGIN:VEVENT UID:20230626T154010CEST-7024h7vLcs@mb-1.laga.fr DTSTAMP:20230626T134010Z CATEGORIES:SEMINAIRE MB DESCRIPTION:Alexis Léculier\n DTSTART:20220121T110000 DTEND:20220121T120000 LOCATION:Séminaire en distancielGGé SUMMARY:Analysis of two "\;Rolling carpet"\; strategies to eradicat e an invasive species END:VEVENT BEGIN:VEVENT UID:20230626T154010CEST-7044OMvveP@mb-1.laga.fr DTSTAMP:20230626T134010Z CATEGORIES:SEMINAIRE MB DESCRIPTION:Joan Alexis Glaunès Le\n thème général de cet exposé est le rec alage difféomorphique et la \nconstruction d'atlas\, avec des applications principalement en analyse \nd'images médicales. Je présenterai d'abord de s modèles issus de la \nthéorie géométrique de la mesure: courants\, varif olds et cycles normaux\,\n permettant de construire des termes d'attache p our le recalage de \ndonnées géométriques extraites des images. J'évoquera i ensuite deux \nprojets applicatifs en cours\, sur la labellisation autom atique d'arbres \nvasculaires et sur le recalage d'IRM cérébraux avec glio blastomes. \nEnfin\, je parlerai également de la librairie de calcul KeOps \, développée\n initialement pour le calcul rapide des opérations de convo lution qui \nsont au coeur de ces algorithmes de recalage\, mais qui trouv e son \nutilité dans un cadre beaucoup plus général. DTSTART:20220114T140000 DTEND:20220114T150000 LOCATION:Séminaire en distancielGGé SUMMARY:Méthodes géométriques pour le recalage difféomorphique et la constr uction d'atlas\, pour l'analyse d'images médicales END:VEVENT BEGIN:VEVENT UID:20230626T154010CEST-7065K4M8Gc@mb-1.laga.fr DTSTAMP:20230626T134010Z CATEGORIES:SEMINAIRE MB DESCRIPTION:Sophie Pénisson\n Pourquoi les virus sont-ils si fragiles ?& \;nbsp\; S'ils subissent de nouvelles mutations à chaque cycle de réplicat ion\, pourquoi les génomes des virus à ARN sont-ils si fragiles\, la plupa rt des mutations étant soit fortement délétères\, soit létales? Nous fourn issons ici des preuves théoriques de l'hypothèse selon laquelle la fragili té génétique évolue en raison des goulots d'étranglement omniprésents que connaissent les populations virales à différents stades de leur cycle de v ie. En modélisant les populations virales intra-hôte par des processus de branchement\, nous montrons que la fragilité mutationnelle augmente de man ière contre-intuitive la probabilité de survie à travers ces multiples gou lots d'étranglement\, ainsi que la fitness moyenne asymptotique de la popu lation. Ces conclusions sont basées sur des résultats pour des processus d e branchement réductibles avec une infinité de types.&\;nbsp\; Dans le cadre d'un modèle épidémiologique compartimental SEIR\, nous constatons qu e le taux d'attaque des souches virales fragiles peut dépasser celui des s ouches plus robustes\, en particulier pour de faibles infectiosités et des taux de mutation élevés. Nos résultats soulignent l'importance des événem ents démographiques tels que les goulets d'étranglement lors de la transmi ssion dans le façonnement de l'architecture génétique des pathogènes virau x. DTSTART:20220111T100000 DTEND:20220111T110000 LOCATION:Salle B405\, bâtiment B\, LAGA\, Institut Galilée\, Université Par is 13GGé SUMMARY:Pourquoi les virus sont-ils si fragiles ? END:VEVENT BEGIN:VEVENT UID:20230626T154010CEST-7071wAtVp2@mb-1.laga.fr DTSTAMP:20230626T134010Z CATEGORIES:SEMINAIRE MB DESCRIPTION:Gwenaël Peltier\n When the environment is heterogeneous\, the s ituation is much more complex. Depending on the profile of heterogeneities \, the invasion may be either slowed or completely blocked. In some cases\ , the population adaption to the local environment is crucial for invasion to occur. We first consider a linear profile of heterogeneities\, and the n investigate the fully nonlinear case numerically as well as analytically (in a perturbative framework for the latter). DTSTART:20220107T110000 DTEND:20220107T120000 LOCATION:Salle B405\, bâtiment B\, LAGA\, Institut Galilée\, Université Par is 13GGé SUMMARY:Biological invasions: the role of adapation for heterogeneous envir onments END:VEVENT BEGIN:VEVENT UID:20230626T154010CEST-7602WaI4KC@mb-1.laga.fr DTSTAMP:20230626T134010Z CATEGORIES:SEMINAIRE MB DESCRIPTION:Safaa Al Ali Inflammatory bowel disease (IBD) encompasses two m ajor type of digestive\n tract disorders: Crohn’s disease (CD) and Ulcerat ive Colitis disease \n(UC). &\;nbsp\;To evaluate disease severity\, gas troenterologists visualize the \nintestinal inner wall using Wireless Caps ule Endoscopy (WCE) in the case\n of CD\, and colonoscopy in the case for UC. The obtained endoscopic \nvideos usually present a huge amount of imag es to analyze in order to \ndetect lesions as bleeding\, ulcers and erosio n and thereby assess \ndisease activity and make treatment decisions. But this procedure \nrequires an experienced doctor who may spend very long ti me to review \nthe video. In this talk\, we propose an algorithm &\;nbs p\;to automatically \ndetect endoscopic lesions and a modified sensitivity to count for \ndoctors annotation errors in our database. In addition\, w e use the class\n of reaction-diffusion equations to model the spatial dis tribution of \nthe lesions and then estimate the long time behavior of the disease. \n&\;nbsp\;Due to the collaboration between LAGA and Bichat-B eaujon hospitals \n(Éric Ogier Denis and Xavier Tréton)\, all the presente d results concern \ncolonoscopy videos for UC patients. \n DTSTART:20210618T130000 DTEND:20210618T140000 LOCATION:Séminaire en ligne\, commun avec http://inflamex.frGGé SUMMARY:Inflammatory bowel diseases : mathematical modelling and image anal ysis END:VEVENT BEGIN:VEVENT UID:20230626T154010CEST-7784MbCeFt@mb-1.laga.fr DTSTAMP:20230626T134010Z CATEGORIES:SEMINAIRE MB DESCRIPTION:Jorge Estrada En raison du nombre de maladies qu'ils transmette nt\, les moustiques sont\n considérés comme l'une des plus dangereuses esp èces animales pour les \nhumains. La technique des insectes stériles (SIT) est une méthode \nclassique de lutte antivectorielle qui a été appliqué a vec succès contre\n diverses invasions d'insectes depuis les années 1950. Ces dernières \nannées\, plusieurs pays ont utilisé le SIT pour contrôler les populations\n de moustiques\, afin de limiter la propagation des malad ies. La SIT \nclassique consiste en la relâche d'un grand nombre de mousti ques mâles \nstérilisés\, ce qui entraîne une réduction progressive de la population \ntotale. \n \nSur la base du modèle ODE dans [1]\, nous présento ns un modèle PDE qui \nreprésente la libération de moustiques mâles stéril es dans une zone \nlimitée dans une zone plus grande contenant une populat ion de moustiques\n naturels. Nous souhaitons contrôler la population à l' intérieur de la \nrégion de relâche et bloquer la ré-invasion des moustiqu es provenant de \nl'extérieur. Nous adaptons la méthode géométrique de Lew is &\;amp\; Keener \n[2] et étendons leur résultat principal\, pour tro uver des relations sur \nla taille de la région de libération et la densit é des mâles stériles \nlibérés qui nous permettront d'accomplir cela. Nous effectuons des \nsimulations numériques pour le modèle spatial afin d'obs erver la \nprésence d'un blocage des vagues pour une libération suffisamme nt \nimportante de mâles stériles. Nous simulons également plusieurs \nstr atégies de relâches de moustiques pour le modèle ODE. \n \n[1] M. Strugarek\ , H. Bossin\, Y. Dumont\, On the use of the sterile insect\n technique or the incompatible insect technique to reduce or eliminate \nmosquito popula tions\, Applied Mathematical \nModelling\,&\;nbsp\;2019&\;nbsp\;68&am p\;nbsp\;:&\;nbsp\;443{470. \n \n[2] T.J. Lewis\, J.P. Keener\, Wave-bloc k in excitable media due to regions of depressed excitability\, \nSIAM&\ ;nbsp\;J.&\;nbsp\;Appl.&\;nbsp\;Math.&\;nbsp\;61&\;nbsp\;(2000 )\,&\;nbsp\;293-316. DTSTART:20210511T132000 DTEND:20210511T134000 LOCATION:Séminaire en ligneGGé SUMMARY:The Sterile Insect Technique used as a barrier control against rein festation END:VEVENT BEGIN:VEVENT UID:20230626T154010CEST-7791M1GfCA@mb-1.laga.fr DTSTAMP:20230626T134010Z CATEGORIES:SEMINAIRE MB DESCRIPTION:Samar Allouch\n \n DTSTART:20210511T130000 DTEND:20210511T132000 LOCATION:Séminaire en ligneGGé SUMMARY:Mathematical analysis of an adhesive point submitted to an external force of bounded variation END:VEVENT BEGIN:VEVENT UID:20230626T154010CEST-79507568UN@mb-1.laga.fr DTSTAMP:20230626T134010Z CATEGORIES:SEMINAIRE MB DESCRIPTION:Guillemette Chapuisat\n \n DTSTART:20210402T140000 DTEND:20210402T150000 LOCATION:Séminaire en ligne\, commun avec MCSGGé SUMMARY:Modélisation de la croissance cancéreuse et optimisation de chimiot hérapie END:VEVENT BEGIN:VEVENT UID:20230626T154010CEST-8034UXvISl@mb-1.laga.fr DTSTAMP:20230626T134010Z CATEGORIES:SEMINAIRE MB DESCRIPTION:Sébastien Li-Thiao-Té\n \n DTSTART:20210319T140000 DTEND:20210319T150000 LOCATION:Séminaire en ligne\, commun avec MCSGGé SUMMARY:Introduction à l'apprentissage. Quelques algorithmes classiques et problèmes soulevés END:VEVENT BEGIN:VEVENT UID:20230626T154010CEST-82866kUbvM@mb-1.laga.fr DTSTAMP:20230626T134010Z CATEGORIES:SEMINAIRE MB DESCRIPTION:Ian Morilla &\;amp\; Alexy Tran Dinh Lung transplantation is the treatment of last resort that may be offered\n to selected patients w ith end-stage pulmonary disease. Acute cell \nrejection (ACR) is common co mplication that have nearly the 30% of lung \ntransplant recipients within the first year of follow-up. The \ndevelopment of surrogate markers that could help identify recipients at \nrisk of developing ACR would be a majo r diagnostic aid to the clinician.\n CD31\, the receptor most represented on the endothelial surface\, is \ncleaved and released into the plasma upo n endothelial activation and is \ntherefore a powerful biomarker of endoth elial dysfunction. \n \nWe evaluated the contribution of artificial intellig ence in the \nprediction of the risk of rejection after lung transplantati on using \nearly soluble CD31 plasma levels in combination with recipient hematosis\n as measured by PaO2/FiO2. To this end\, a deep convolutional n eural \nnetwork is useful to reconstruct the underlying non-linear behavio ur of \nCD31 portrayed as time series. Finally\, based on this model we ar e able \nto build a risk predictor of ACR with an associated percentage &a mp\;nbsp\;&\;nbsp\;&\;nbsp\;of \naccuracy to each individual. DTSTART:20210209T130000 DTEND:20210209T140000 LOCATION:Séminaire en ligne.GGé SUMMARY: Personalised risk predictor for acute cellular rejection in lung t ransplantation END:VEVENT BEGIN:VEVENT UID:20230626T154010CEST-8482X9tikv@mb-1.laga.fr DTSTAMP:20230626T134010Z CATEGORIES:SEMINAIRE MB DESCRIPTION:Émeric Bouin anomalousit is a governed\n by a fraction al diffusion equation. Lebeau and Puel proved\n last year the fir st similar result for Fokker-Planck operator\,\n in dimension 1 a nd assuming that the equilibrium distribution\n has finite mass. Fournier and Tardif gave an alternative\n probabilistic proof\, m ore general (covering any dimension and\n infinite-mass equilibri um distribution) but non-constructive.\n We present a unified ele mentary approach\, fully quantitative\,\n that covers all previou s cases as well as new ones. This is a\n joint work with Clément Mouhot (University of Cambridge). DTSTART:20210105T130000 DTEND:20210105T140000 LOCATION:Sans doute en ligne (à confirmer).GGé SUMMARY:Unified approach to fluid approximation of linear kinetic equations with heavy tails END:VEVENT BEGIN:VEVENT UID:20230626T154010CEST-8786fnBuni@mb-1.laga.fr DTSTAMP:20230626T134010Z CATEGORIES:SEMINAIRE MB DESCRIPTION:Dylan Dronnier\n Dans une population homogène\, le nombre de re production de base\, noté R0\, est défini comme le nombre attendu de cas d irectement générés par une personne contagieuse quand tous les autres indi vidus sont sensibles à l'infection. Ce nombre joue un rôle fondamental en épidémiologie puisqu'il donne un seuil pour déterminer si l'épidémie va fi nir par disparaître (cas R0 &\;lt\; 1) ou\, au\ncontraire\, devenir end émique (cas R0 &\;gt\; 1).\nDe cette propriété\, on déduit que si une p roportion 1 -1/R0 de la population est immunisée (par vaccination par exem ple) alors on parvient à éliminer l'infection. Cette dernière quantité est appelée seuil d'immunité collective de la population. Elle est souvent pr ise en compte pour évaluer l'efficacité d'une politique sanitaire (dans la gestion de la COVID-19 par exemple). \n\nQuand les contacts dans la popul ation ne sont plus homogènes\, le nombre de reproduction de base est défin i comme le nombre de cas directement générés par une personne infectée typ ique quand tous les autres individus sont sensibles à l'infection. Le seui l d'immunité collective 1-1/R0 reste encore valide quand on vaccine la pop ulation uniformément. Il est cependant naturel de se demander si l'on ne p ourrait pas baisser ce seuil en ciblant certains groupes dans la populatio n.\nDans la première partie de l'exposé\, je présenterai un modèle SIS (Su sceptible -&\;gt\; Infecté -&\;gt\; Susceptible) en dimension infini e avec vaccination. Ce modèle servira de base pour défnir les stratégies o ptimales de vaccination. Dans la seconde partie\, je donnerai des exemples où les solutions du problème de vaccination optimales sont explicites.\n DTSTART:20201124T130000 DTEND:20201124T140000 LOCATION:Séminaire en ligne.GGé SUMMARY:Stratégies de vaccination ciblée END:VEVENT BEGIN:VEVENT UID:20230626T154010CEST-8858PhIRu5@mb-1.laga.fr DTSTAMP:20230626T134010Z CATEGORIES:SEMINAIRE MB DESCRIPTION:Marion Darbas Dans cet exposé\, je présenterai des résultats li és à des applications en\n imagerie cérébrale qui utilisent la propagation des ondes \nélectromagnétiques. Chacune d’entre elles nous amène à résoud re un \nproblème inverse. La première concerne l’électroencéphalographie c hez le\n nouveau-né et la localisation de sources épileptiques. La seconde pose \nla question du diagnostic d’accidents vasculaires cérébraux par im agerie\n micro-ondes et est basée sur la résolution d'un problème inverse de \ncoefficients diélectriques. Enfin\, je dirai quelques mots sur la \nt omographie par impédance électrique. DTSTART:20201110T130000 DTEND:20201110T140000 LOCATION:Séminaire en ligne.GGé SUMMARY:Propagation des ondes électromagnétiques\, calcul scientifique et a pplications médicales END:VEVENT BEGIN:VEVENT UID:20230626T154010CEST-9070ivsx4c@mb-1.laga.fr DTSTAMP:20230626T134010Z CATEGORIES:SEMINAIRE MB DESCRIPTION:Sébastien Li-Thiao-Té \nÉcrire un papier\, développer un code s ource\, monter un projet\, sont des \ntâches qui font intervenir les mêmes processus de travail. Notamment\, \nces travaux nécessitent la collaborat ions de plusieurs contributeurs\, \nqui proposent du texte\, des modificat ions\, et commentent les \npropositions de leurs pairs. \nLa plupart des ma thématiciens connaissent LaTeX\, voire Overleaf\, qui \nsont des outils dé jà anciens. Quels sont les avantages / améliorations \napportées par les o utils modernes\, notamment l'intégration continue \n(CI/CD) ? \nJe présente rai Git et GitLab (disponibles notamment sur Mathrice)\, et \ncomment on p eut les utiliser concrètement pour collaborer dans un groupe\n de recherch e. DTSTART:20200706T140000 DTEND:20200706T150000 LOCATION:Big Blue Button LAGAGGé SUMMARY:Un outil et quelques réflexions sur le travail collaboratif (écritu re de papiers\, codes sources\, etc.) END:VEVENT BEGIN:VEVENT UID:20230626T154010CEST-9244vnTXg0@mb-1.laga.fr DTSTAMP:20230626T134010Z CATEGORIES:SEMINAIRE MB DESCRIPTION:Marie Postel Je\n présenterai les résultats d'un travail inter disciplinaire avec des \nbiologistes de l'IBPS qui a débouché sur un modèl e mathématique de la&\;nbsp\; neurogenèse\n corticale. Ce processus emb ryonnaire combine les divisions de cellules \nprogénitrices de deux princi paux types. Les effectifs\, taux de divisions\n et durées de cycles de ces progéniteurs conditionnent l'effectif final \nde neurones.&\;nbsp\;Pou r comprendre les rôles respectifs de ces facteurs dans \nla neurogenèse\, nous combinons des études expérimentales in vivo avec \nles simulations nu mériques de la dynamique des progéniteurs. Un \nformalisme&\;nbsp\;mult i échelles nous permet de suivre la progression de types \nde progéniteurs spécifiques tout au long des phases du cycle cellulaire.\n Nous ajustons les valeurs numériques du modèle de manière à \ncorrespondre avec des effe ctifs cellulaires&\;nbsp\;expérimentaux obtenus sur un\n modèle de sour is. L'apport des différentes quantités observables \nexpérimentalement est analysé du point de vue de l'identifiabilité du \nmodèle mathématique. DTSTART:20200513T150000 DTEND:20200513T160000 LOCATION:Séminaire en ligne\, commun avec MCSGGé SUMMARY:Un modèle mathématique de la neurogénèse corticale END:VEVENT BEGIN:VEVENT UID:20230626T154010CEST-92922nATpI@mb-1.laga.fr DTSTAMP:20230626T134010Z CATEGORIES:SEMINAIRE MB DESCRIPTION:Vuk Milisic Dans le&\;nbsp\;contexte de la&\;nbsp\;motili té&\;nbsp\;cellulaire\, on introduit le&\;nbsp\; Filament Based Lame llipodium &\;nbsp\;Model (FBML) et on montre les&\;nbsp\;différentes \n situations biologiques que ce modèle permet de&\;nbsp\;reproduire. D ans ce \ncadre\, on s'intéresse à la modélisation et à l'analyse&\;nbsp \;mathématique des \nforces d'adhésion que l'on présente dans un deuxième &\;nbsp\;temps. On \nintroduit une approche par flot gradient avec cont rainte et on montre la\n convergence du schéma &\;nbsp\;discret en temp s et en age vers un modèle \ncontinu. Dans un deuxième temps on démontre l a convergence &\;nbsp\;de ce \ndernier vers l'équation de la chaleur su r la sphère unité avec un \nparamètre de friction qui vient des termes de retard de notre modèle. DTSTART:20200428T140000 DTEND:20200428T150000 LOCATION:Big Blue Button LAGAGGé SUMMARY:Modélisation et analyse mathématique des forces d'adhésion dans le contexte de la motilité cellulaire : une approche par flot gradient. END:VEVENT BEGIN:VEVENT UID:20230626T154010CEST-9359f0BMK7@mb-1.laga.fr DTSTAMP:20230626T134010Z CATEGORIES:SEMINAIRE MB DESCRIPTION:Nicolas Vauchelet Cans\n cet exposé\, je présenterai quelques e xemples de travaux mathématiques \nqui peuvent être effectués dans le cont exte de contrôle de maladies \ntransmises par des moustiques. Plus précisé ment\, je m'intéresserai à la \nméthode dite de Wolbachia consistant à ess ayer de répandre une bactérie \nbloquant la transmission des arbovirus dan s la population de vecteurs DTSTART:20200415T150000 DTEND:20200415T160000 LOCATION:Séminaire en ligne\, commun avec MCSGGé SUMMARY:Modélisation mathématique de nouvelles techniques de contrôle de ma ladies vectorielles END:VEVENT BEGIN:VEVENT UID:20230626T154010CEST-9468mhnW0f@mb-1.laga.fr DTSTAMP:20230626T134010Z CATEGORIES:SEMINAIRE MB DESCRIPTION:Guillemette Chapuisat La\n croissance d'une tumeur peut être m odélisée par une onde progressive \nsolution d'une équation ou d'un systèm e de réaction-diffusion. L'étude \nde fronts de propagation solution de ce s systèmes de réaction-diffusion \net en particulier de leur vitesse perme t donc de mieux comprendre la \ncroissance d'une tumeur soumise à une chim iothérapie. Dans cet exposé\, \nje présenterai deux exemples de tels trava ux. Le premier porte sur \nl'influence de la période du traitement sur son efficacité et amène donc\n à étudier des équations de réaction-diffusion périodiques ou \nasymptotiquement périodiques en temps. Le second porte su r \nl'hétérogénéité tumorale et en particulier sur l'influence de la \npré sence de cellules résistantes au traitement et amènera à étudier un \nprob lème de propagation de terrasses de fronts dans un système de \ncompétitio n-diffusion. DTSTART:20200313T130000 DTEND:20200313T140000 LOCATION:Salle B405\, bâtiment B\, LAGA\, Institut Galilée\, USPNGGé SUMMARY:Propagation de fronts et croissance tumorale END:VEVENT BEGIN:VEVENT UID:20230626T154010CEST-9523JrMuT9@mb-1.laga.fr DTSTAMP:20230626T134010Z CATEGORIES:SEMINAIRE MB DESCRIPTION:Mounîm A. El Yacoubi\n L’intelligence artificielle connaît aujo urd’hui un essor sans précédent dans le monde en raison\, essentiellement\ , du développement spectaculaire de machines de calcul puissantes et des a vancées en machine Learning qui ont suivi en parallèle. Dans ce séminaire\ , nous présentons une introduction aux méthodes de Machine Learning\, en m ettant l’accent sur leur catégorisation en méthodes d’apprentissage Superv isé\, non-supervisé et semi-supervisé\, tout en abordant d’autres types de catégorisation. Dans ce cadre\, nous nous intéresserons\, entre autres\, aux modèles de réseaux de neurones profonds. Dans l’exposé\, nous présento ns quelques applications concernant des données humaines telles que l’anal yse de l’écriture sur tablette pour la caractérisation de maladies neurodé génératives\, la biométrie des veines de la main\, la prédiction de glycém ie chez des patients\ndiabétiques\, ou l’analyse de la mobilité humaine à partir des traces numériques des smartphones. Pour ces applications\, nous expliquerons les problématiques de machine Learning posées ainsi les prin cipes qui ont guidé les choix de modèles considérés.\n DTSTART:20200306T150000 DTEND:20200306T160000 LOCATION:Salle B405\, bâtiment B\, LAGA\, Institut Galilée\, Université Par is 13GGé SUMMARY:Application de méthodes de Machine Learning sur des données humaine s END:VEVENT BEGIN:VEVENT UID:20230626T154010CEST-9532vsBA7K@mb-1.laga.fr DTSTAMP:20230626T134010Z CATEGORIES:SEMINAIRE MB DESCRIPTION:Mehdi Ammi Le déploiement des environnements pervasifs&\;nbs p\;constitue un tournant \nimportant dans le processus de mutation de notr e société.&\;nbsp\;Il s'agit d'un\n vecteur de transformation majeur de nature à bouleverser nos&\;nbsp\;modes de \nproduction\, de consommati on\, de transport\, d'habitation\, ou encore \nde&\;nbsp\;travail. Dans le domaine particulier de la santé\, ces environnements \npourraient&\ ;nbsp\;proposer des solutions crédibles aux nombreux défis&\;nbsp\;auxq uels \nnotre société sera&\;nbsp\;confrontée ces prochaines décennies : augmentation et\n vieillissement de la&\;nbsp\;population\, suivi des maladies chroniques\, \nsédentarité croissante\,&\;nbsp\;obésité/diabèt e\, etc. Si les évolutions \ntechnologiques&\;nbsp\;récentes permettent de donner corps à ces nouveaux \nenvironnements\, il reste&\;nbsp\;tout efois un certain nombre de défis à résoudre\n pour rendre cette&\;nbsp\ ;transformation crédible\, efficace et&\;nbsp\;acceptable par \nla soci été (mécatronique adaptée\,&\;nbsp\;traitement robuste des données\, \n éthique\, etc.). L'élaboration d'une interaction&\;nbsp\;homme-environn ement \nprenant en considération les différentes composantes de&\;nbsp\ ;l'humain \n(profil\, état\, activité\, besoin\, etc.) et son \nenvironnem ent&\;nbsp\;(environnement physique\, contexte\, etc.) est une \nproblé matique clé pour le&\;nbsp\;succès de ces approches. En effet\, ces \nc omposantes évoluent au cours&\;nbsp\;du temps\,&\;nbsp\;en fonction de l'environnement \net du contexte associé. Une interaction avec des&\ ;nbsp\;paramètres statiques \nrisque ainsi de compromettre l'expérience ut ilisateur et&\;nbsp\;l'utilisabilité\n du système\, voire même son&\ ;nbsp\;utilité (ex. attente\, satisfaction&\;nbsp\;du \nbesoin). L'inte raction entre l'homme et l'environnement doit donc \nêtre&\;nbsp\;adapt ée en fonction des spécificités de l'humain\, en fonction de \nson activit é\,&\;nbsp\;en fonction du temps\, en&\;nbsp\;fonction de l'environn ent \nphysique et en fonction des&\;nbsp\;tâches réalisées. En résumé\, il est \nnécessaire d'élaborer pour ces nouveaux&\;nbsp\;environnement s une interaction \nhomme-environnement plastique permettant&\;nbsp\;d' adapter d'une manière \ndynamique les paramètres du modèle de l'interactio n en&\;nbsp\;fonction de \nl'ensemble des composantes impliquées. DTSTART:20200306T140000 DTEND:20200306T150000 LOCATION:Salle B405\, bâtiment B\, LAGA\, Institut Galilée\, Université Par is 13GGé SUMMARY:Interaction Homme-Environnement dans la E-Santé END:VEVENT BEGIN:VEVENT UID:20230626T154010CEST-9579iBlBLr@mb-1.laga.fr DTSTAMP:20230626T134010Z CATEGORIES:SEMINAIRE MB DESCRIPTION:Xavier Claeys\n Les méthodes de Schwarz optimisées (OSM) sont d es stratégies de décomposition de domaine\n(DDM) bien établies pour la rés olution des équations d'ondes en régime fréquentiel.\nDans ces méthodes\, les problèmes d'onde sont résolues indépendamment dans chaque sous-domaine s en imposant des conditions de type Robin aux frontières. Le couplage ent re sous-domaines est assuré par un échange des traces Robin aux interfaces . Quand le partitionnement ne fait pas intervenir de point de jonction (c' est-à-dire des points où 3 sous-domaines ou plus sont adjacents)\, cette\n stratégie peut être très efficace à condition que les coefficients d'impéd ance soient choisis\nintelligemment.\n\nLa situation est plus compliquée e n présence de points de jonction et ces points peuvent détériorer substant iellement la convergence des solveurs linéaires\, même dans des configurat ions géométriques banales. Le traitement des points de jonctions a été l'o bjet de contributions multiples et\, bien qu'il existe maintenant des appr oches convaincantes dans le cas de jonctions à angle droit\, aucun traitem ent systématique n'a vraiment été proposé jusqu'à présent.\n\nDans cet exp osé nous présenterons une nouvelle variante de OSM qui peut s'accommoder d e la présence de points de jonctions de forme arbitraire. L'ingrédient nou veau est un opérateur d'échange modifié qui nécessite le calcul d'une proj ection orthogonale sur l'espace des simples traces (n-uplets de traces qui se raccordent aux interfaces) à chaque itération du solveur linéaire. L'o rthogonalité de cet opérateur d'échange nous permet d'établir une théorie de convergence uniforme par rapport au pas du maillage. Nous présenterons des résultats numériques en 2D et 3D qui confirment notre théorie.\n\nCe t ravail a été réalisé en collaboration avec Emile Parolin (INRIA POems) dan s le cadre du projet ANR NonlocalDD ref. ANR-15-CE23-0017-01. DTSTART:20200228T143000 DTEND:20200228T153000 LOCATION:Salle B405\, bâtiment B\, LAGA\, Institut Galilée\, Université Par is 13GGé SUMMARY:Nouvelle approche pour les points de jonction dans les méthodes de Schwarz optimisées END:VEVENT BEGIN:VEVENT UID:20230626T154010CEST-9595mmFzVw@mb-1.laga.fr DTSTAMP:20230626T134010Z CATEGORIES:SEMINAIRE MB DESCRIPTION:Ulrich Razafison Dans cet exposé\, nous nous placerons dans le cadre du trafic piéton et nous\n présenterons un modèle permettant de décr ire la chute de capacité \n(c'est-à-dire le flux de piétons maximal par un ité de temps)d'une sortie de salle lors d'une évacuation. Le modèle repose sur une loi de conservation et la capacité de la sortie est décrite par u ne contrainte sur le flux\, qui est supposée non locale. La chute de capac ité se produit pour les hautes densités de piétons exprimant la congestion de la sortie.Par des simulations numériques\, nous montrerons que le modè le est capable de reproduire deux effets paradoxales liés&\;nbsp\; à\n la chute de capacité et qui ont déjà été observés et reproduits \nexpérime ntalement : l'effet ''Faster-Is-Slower"\; qui stipule qu'une augmentat ion\n de la vitesse des piétons peut entraîner une augmentation du temps \nd'évacuation\, et une variante du "\;paradoxe de Braess"\; qui \nindique que placer un obstacle avant la sortie peut faire diminuer la \n pression des piétons sur la sortie et entraîner une réduction du temps d'é vacuation.&\;nbsp\;Ces travaux sont en collaboration avec Boris Andreia nov\, Carlotta Donadello et Massimiliano Rosini. DTSTART:20200228T133000 DTEND:20200228T143000 LOCATION:Salle B405\, bâtiment B\, LAGA\, Institut Galilée\, Université Par is 13GGé SUMMARY:Modélisation macroscopique de trafic piéton dans le contexte d'une évacuation de salle END:VEVENT BEGIN:VEVENT UID:20230626T154011CEST-0057lGZJCe@mb-1.laga.fr DTSTAMP:20230626T134011Z CATEGORIES:SEMINAIRE MB DESCRIPTION:Paul Vigneaux (Séminaire commun avec MCS). Nous\n présenterons des schémas numériques 2D pour résoudre des modèles de \ntype Saint-Venant dont le problème en vitesse est une inéquation \nvariationnelle. Ce type de formulation intervient lorsque l’on \ns’intéresse à des écoulements de matériaux viscoplastiques\, par exemple \nen géophysique (glissement de te rrain\, avalanche de neige dense pouvant \nêtre décrits par une loi de typ e Bingham). Nous illustrerons cela sur \ndes topographies du massif du Mon t-Blanc (couloir de Taconnaz). DTSTART:20191115T140000 DTEND:20191115T150000 LOCATION:Salle B405\, bâtiment B\, LAGA\, Institut Galilée\, Université Par is 13GGé SUMMARY:Modélisation des avalanches END:VEVENT BEGIN:VEVENT UID:20230626T154011CEST-0124FNV8lZ@mb-1.laga.fr DTSTAMP:20230626T134011Z CATEGORIES:SEMINAIRE MB DESCRIPTION:Astrid Decoene\n Séminaire commun avec MCS\n DTSTART:20191108T140000 DTEND:20191108T150000 LOCATION:Salle B405\, bâtiment B\, LAGA\, Institut Galilée\, Université Par is 13GGé SUMMARY:Modélisation et simulation numérique de fluides visqueux entraînés par des cils actifs. END:VEVENT BEGIN:VEVENT UID:20230626T154011CEST-01344Ubw20@mb-1.laga.fr DTSTAMP:20230626T134011Z CATEGORIES:SEMINAIRE MB DESCRIPTION:M Clertant\n \n DTSTART:20191108T130000 DTEND:20191108T140000 LOCATION:Salle B405\, bâtiment B\, LAGA\, Institut Galilée\, Université Par is 13GGé SUMMARY:Apprentissage statistique et essais cliniques END:VEVENT BEGIN:VEVENT UID:20230626T154011CEST-0355lzcKjt@mb-1.laga.fr DTSTAMP:20230626T134011Z CATEGORIES:SEMINAIRE MB DESCRIPTION:Sébastien Martin Contrairement aux fluides ordinaires\, les flu ides complexes &\;nbsp\;révèlent \ndes comportements non triviaux qui d épendent de structures &\;nbsp\;internes qui\n composent ces fluides. T ypiquement\, de nombreux fluides &\;nbsp\;complexes sont\n composés d'e ntités microscopiques\, actives ou passives. &\;nbsp\;Le \ncomportement individuel et collectif de ces entités a un impact &\;nbsp\;très \nfor t sur les propriétés rhéologiques du fluide à l'échelle \n&\;nbsp\;macr oscopique. La réponse de l'échelle micro- sur l'échelle macro- \n&\;nbs p\;nécessite des efforts de compréhension importants pour ces fluides. \n& amp\;nbsp\;Dans cet exposé\, nous présenterons une méthode de simulation d irecte \n&\;nbsp\;de suspensions denses de micronageurs dans un fluide visqueux. On \n&\;nbsp\;s'intéresse en particulier à des bactéries muni es de flagelles\, et qui \n&\;nbsp\;nagent dans un fluide newtonien par auto-propulsion. La méthode \n&\;nbsp\;numérique s'attache à la résolu tion du problème de couplage fort entre \n&\;nbsp\;le fluide et les str uctures rigides qui représentent les bactéries au \n&\;nbsp\;niveau ind ividuel. Les résultats numériques concernent aussi bien les \n&\;nbsp\; grandes recirculations qui sont observées dans des suspensions denses \n&a mp\;nbsp\;que la rhéologie de ces suspensions (selon le type de motilité d es \n&\;nbsp\;micronageurs). En conclusion\, nous présenterons quelques extensions \n&\;nbsp\;(chimiotactisme) et pistes de travail actuelles (modélisation des \n&\;nbsp\;flagelles eux-mêmes\, afin de capturer des effets hydrodynamiques plus \n&\;nbsp\;fins qu'à l'échelle de la suspe nsion). DTSTART:20190927T150000 DTEND:20190927T160000 LOCATION:Salle B405\, bâtiment B\, LAGA\, Institut Galilée\, Université Par is 13GGé SUMMARY:Simulation directe de suspensions denses de bactéries. END:VEVENT BEGIN:VEVENT UID:20230626T154011CEST-0363uesUVS@mb-1.laga.fr DTSTAMP:20230626T134011Z CATEGORIES:SEMINAIRE MB DESCRIPTION:Philippe Peyla \n \n \n \n &\;lt\;style type="\;text/css "\;&\;gt\;p { margin-bottom: 0.25cm\; direction: ltr\; color: rgb(0 \, 0\, 10)\; line-height: 115%\; text-align: left\; }p.western { font-fami ly: "\;Liberation Serif"\;\, serif\; font-size: 12pt\; }p.cjk { fo nt-family: "\;Noto Serif CJK SC"\;\; font-size: 12pt\; }p.ctl { fo nt-family: "\;Lohit Devanagari"\;\; font-size:&\;lt\;/style& \;gt\;&\;lt\;font face="\;arial"\;>\;Après une introduction g énérale sur la nage des micro-organismes à\nbas nombres de Reynolds\, je p résenterai quelques expériences faites\nau laboratoire sur du plancton. Le s micro-algues motiles que nous\nutilisons sont les Chlamydomonas Reinhard tii\, elles sont\nphoto-sensibles et\, selon la souche de cellule utilisée \, sont\nattirées ou fuient la lumière. En l’absence de lumière\, ces\nalg ues ont un mouvement de marche aléatoire avec longueur de\npersistance& \;nbsp\;\; en présence de lumière\, elles se déplacent de\nfaçon balistiqu e. Ici notre objectif est d’étudier des objets\nmobiles et de comprendre c omment les mouvements microscopiques\npeuvent affecter des déplacement mac roscopiques. Ces études\, si\nelles ont un caractère fondamental\, peuvent avoir des applications\nimportantes. En effet\, ces algues ont un fort po tentiel pour la\nfabrication de bio-carburants (bio-diesel\, bio-hydrogène ) et leur\nmanipulation et leur contrôle s’avèrent très importants\nconcer nant les processus de fabrication. \n&\;lt\;style type="\;text/css& quot\;&\;gt\;&\;lt\;/style>\;\n DTSTART:20190927T140000 DTEND:20190927T150000 LOCATION:Salle B405\, bâtiment B\, LAGA\, Institut Galilée\, Université Par is 13GGé SUMMARY:La physique du plancton\, un exemple de fluide actif END:VEVENT BEGIN:VEVENT UID:20230626T154011CEST-0535V2WrVk@mb-1.laga.fr DTSTAMP:20230626T134011Z CATEGORIES:SEMINAIRE MB DESCRIPTION:Xavier Tréton La rectocolite hémorragique (RCH) est une maladie inflammatoire chronique touchant la muqueuse du colon. S’il existe de plu s en plus de traitements disponibles\, seulement 30 à 50% des patients ont un contrôle satisfaisant de leur maladie. Les autres souffrent d’une qual ité de vie altérée\, de complications sévères\, comme les cancers du colon \, nécessitent des interventions chirurgicales radicales. Ce mauvais contr ôle de la maladie est responsable de couts de santé très élevés\, qui vont s’amplifier puisqu'aujourd’hui il existe 2 millions de patients dans le m onde et qu’ils seront 10 millions dans 10 ans. Ces résultats pourraient né anmoins s’améliorer si l’on était capable d’attribuer plus rapidement la b onne classe thérapeutique au bon patient. En ce sens\, des biomarqueurs pr édictifs de la réponse aux traitements sont nécessaires. Cependant\, la na ture multifactorielle de cette maladie\, combinant des facteurs environnem entaux (microbiote\, alimentation\, polluants…)\, (épi)génétiques\, et imm unitaires\, rend la découverte de ces biomarqueurs très complexe. Grâce au x progrès des mathématiques\, des approches intégrées multi-modales sont e ngagées pour tenter d’y arriver. \n \n DTSTART:20190607T143000 DTEND:20190607T153000 LOCATION:Salle B407\, bâtiment B\, LAGA\, Institut Galilée\, Université Par is 13GGé SUMMARY:Rectocolite Hémorragique : une maladie complexe nécessitant l’aide des mathématiques END:VEVENT BEGIN:VEVENT UID:20230626T154011CEST-0550rXxACK@mb-1.laga.fr DTSTAMP:20230626T134011Z CATEGORIES:SEMINAIRE MB DESCRIPTION:John Chaussard Chez des patients atteints de Rectocolite Hémorr agique (RCH)\, l'analyse automatique d'images \nendoscopique pourrait perm ettre de quantifier l'état d'avancement de la \nmaladie. Nous verrons\, da ns cet exposé\, les problèmes que posent le mode\n de prise de vue des ima ges endoscopiques\, faisant obstacle à leur \nanalyse automatique. Nous ve rrons comment certains outils de traitement \nd'images\, provenant de la m orphologie mathématique\, pourraient nous \npermettre de lever ces barrièr es. DTSTART:20190607T133000 DTEND:20190607T143000 LOCATION:Salle B407\, bâtiment B\, LAGA\, Institut Galilée\, Université Par is 13GGé SUMMARY:Morphologie mathématiques et analyse d'image endoscopiques. END:VEVENT BEGIN:VEVENT UID:20230626T154011CEST-0718O5U0rL@mb-1.laga.fr DTSTAMP:20230626T134011Z CATEGORIES:SEMINAIRE MB DESCRIPTION:Delphine Salort Dans cet exposé\, nous nous intéressons à une é quation de \nFokker-Planck qui modélise l'évolution de neurones en interac tion\, où \nchaque neurone perçoit l'activité moyenne du réseau. Nous étud ions\, en \nfonction des hypothèses faites sur le type d’interconnexions \n(inhibiteur/excitateur\, faible/fortes interconnections)\, et sur la \nd ynamique intrinsèque des neurones\, quels sont les types de patterns \npeu vent émerger. Ces travaux sont en collaboration avec Caceres\, Carrillo\, P erthame\, Roux\, Schnaider et Smets. DTSTART:20190418T150000 DTEND:20190418T160000 LOCATION:Salle B407\, bâtiment B\, LAGA\, Institut Galilée\, Université Par is 13GGé SUMMARY:Mécanismes sous-jacents à l'apparition de patterns pour une équatio n de Fokker-Planck en neurosciences END:VEVENT BEGIN:VEVENT UID:20230626T154011CEST-0725Gvg34z@mb-1.laga.fr DTSTAMP:20230626T134011Z CATEGORIES:SEMINAIRE MB DESCRIPTION:Philippe Faure La variation est une composante fonctionnelle de l'expression \ndes&\;nbsp\;comportements\, nécessaire\, à la flexibili té\, à l'acquisition de \nnouvelles connaissances\, et surtout à la défini tion de ce qu'est un \nindividu. Si les processus de stabilisation et de r épétition des \nconduites on été très largement exploré en neuroscience et en science \ncognitives\, ce n'est pas le cas&\;nbsp\;des mécanismes s ous-tendant l’émergence \nde la variabilité. Nous discuterons de deux expé riences mettant en \névidence i) la possibilité de renforcer l'expression de choix variables \nchez un individu et ii) de faire émerger des individu s au comportement \ndistinctes au sein d'une colonie de souris. DTSTART:20190418T140000 DTEND:20190418T150000 LOCATION:Salle B407\, bâtiment B\, LAGA\, Institut Galilée\, Université Par is 13GGé SUMMARY:Variabilité intra et inter-individuelle dans les comportements de S ouris END:VEVENT BEGIN:VEVENT UID:20230626T154011CEST-0739hxjrke@mb-1.laga.fr DTSTAMP:20230626T134011Z CATEGORIES:SEMINAIRE MB DESCRIPTION:Nicolas Vauchelet\n \n DTSTART:20190418T110000 DTEND:20190418T123000 LOCATION:Salle B407\, bâtiment B\, LAGA\, Institut Galilée\, Université Par is 13GGé SUMMARY:Neurosciences\, 6eme séance du cours de l'École Doctorale "\;Bi ological phenomena : description\, modelling and mathematical approach. END:VEVENT BEGIN:VEVENT UID:20230626T154011CEST-0797VL5jjl@mb-1.laga.fr DTSTAMP:20230626T134011Z CATEGORIES:SEMINAIRE MB DESCRIPTION:Tazzio Tissot\n \n DTSTART:20190411T150000 DTEND:20190411T160000 LOCATION:Salle B407\, bâtiment B\, LAGA\, Institut Galilée\, Université Par is 13GGé SUMMARY:Cell evolution\, organism evolution: the case of cancer END:VEVENT BEGIN:VEVENT UID:20230626T154011CEST-0804Pv9iPN@mb-1.laga.fr DTSTAMP:20230626T134011Z CATEGORIES:SEMINAIRE MB DESCRIPTION:Jean Clairambault\n \n DTSTART:20190411T140000 DTEND:20190411T150000 LOCATION:Salle B407\, bâtiment B\, LAGA\, Institut Galilée\, Université Par is 13GGé SUMMARY:Cancer as a default of coherence between tissues in metazoans: what mathematical models should be developed to help prediction\, prevention a nd treatment of cancer\, avoiding drug resistance? END:VEVENT BEGIN:VEVENT UID:20230626T154011CEST-08261GSjJd@mb-1.laga.fr DTSTAMP:20230626T134011Z CATEGORIES:SEMINAIRE MB DESCRIPTION:Nicolas Vauchelet\n \n DTSTART:20190411T110000 DTEND:20190411T123000 LOCATION:Salle B407\, bâtiment B\, LAGA\, Institut Galilée\, Université Par is 13GGé SUMMARY:Mathematical models of tumor growth\, 5eme séance du cours de l'Éco le Doctorale "\;Biological phenomena : description\, modelling and mat hematical approach. END:VEVENT BEGIN:VEVENT UID:20230626T154011CEST-0926Iv6vIo@mb-1.laga.fr DTSTAMP:20230626T134011Z CATEGORIES:SEMINAIRE MB DESCRIPTION:Vincent Calvez Je présenterai un résultat d'existence de soluti ons d'onde pour un \nsystème couplé d'EDP: une équation de transport cinét ique couplée à une \npaire d'équations de réaction-diffusion. Ce modèle dé crit relativement \nbien des ondes de concentration de bactéries telles qu 'observées \nexpérimentalement. Ceci est la suite d'un travail en collabor ation avec \nl'équipe d'Axel Buguin et Pascal Silberzan à l'Institut Curie \, en \nparticulier à l'occasion de la thèse de Jonathan Saragosti. \n \nL'e xistence de solutions ondes est guidée par la limite de diffusion du \npro blème couplé\, mais des difficultés inhérentes à l'échelle mésoscopique né cessitent un travail de description assez fine des \nprofils en vitesse. \n DTSTART:20190328T150000 DTEND:20190328T160000 LOCATION:Salle B407\, bâtiment B\, LAGA\, Institut Galilée\, Université Par is 13GGé SUMMARY:Phénomènes de propagation à l'échelle mésoscopique END:VEVENT BEGIN:VEVENT UID:20230626T154011CEST-0935cXaEg6@mb-1.laga.fr DTSTAMP:20230626T134011Z CATEGORIES:SEMINAIRE MB DESCRIPTION:Axel Buguin\n Nous nous intéressons à des phénomènes collectifs de migration cellulaire qui mettent en jeu une forme de communication ent re cellules vivantes. Cette approche sera illustrée par des expériences me nées sur des bactéries (E. Coli) qui nagent en milieu liquide.\nLes bactér ies E. coli en suspension dans un milieu nutritif donnent naissance à des comportements collectifs dictés d’une part par le chimiotactisme des bacté ries et\, d’autre part\, par leur faculté à produire des molécules attract antes pour communiquer avec les autres bactéries.\nNous étudions ces bacté ries à l’échelle de la population et nous confrontons les résultats obtenu s avec le comportement microscopique de quelques individus au sein de la p opulation.\nUn premier type d’expérience consiste à accumuler les bactérie s à l’extrémité d’un micro-canal. Cette situation peut donner lieu à l’app arition d’ondes de concentration qui se propagent le long du canal. Nous n ous intéresserons à différents facteurs (milieu utilisé\, souche bactérien ne\, géométrie du canal…) susceptibles d’affecter la formation et la propa gation de ces ondes.\nUn second type vise à imposer dynamiquement\, à l’ai de d’un dispositif microfluidique\, l’environnement biochimique dans leque l les bactéries évoluent. Il permet en particulier de faire croître les ba ctéries dans un environnement stable ou de les mettre en compétition face à une source limitée de nutriments.\n DTSTART:20190328T140000 DTEND:20190328T150000 LOCATION:Salle B407\, bâtiment B\, LAGA\, Institut Galilée\, Université Par is 13GGé SUMMARY:Comportements collectifs de bactéries END:VEVENT BEGIN:VEVENT UID:20230626T154011CEST-09502Dw6Rl@mb-1.laga.fr DTSTAMP:20230626T134011Z CATEGORIES:SEMINAIRE MB DESCRIPTION:Nicolas Vauchelet\n \n DTSTART:20190328T110000 DTEND:20190328T123000 LOCATION:Salle B407\, bâtiment B\, LAGA\, Institut Galilée\, Université Par is 13GGé SUMMARY:Bacterial motion\, chemotaxis\, 4eme séance du cours de l'École Doc torale "\;Biological phenomena : description\, modelling and mathemati cal approach. END:VEVENT BEGIN:VEVENT UID:20230626T154011CEST-13912hMUK0@mb-1.laga.fr DTSTAMP:20230626T134011Z CATEGORIES:SEMINAIRE MB DESCRIPTION:Léo Girardin In this talk\, I will first present two classical notions of population dynamics\, namely predator—prey systems &\;amp\; Allee effects. I will then give a state-of-the-art review on reaction—diff usion \npredator–prey systems with Allee effect on the prey\, highlighting the range of possible outcomes and the lack of general theory. Finally\, I will explain how these notions can be used to prove an unexpected&\;n bsp\; co-extinction theorem for a brake-driven gene drive reversal model. \nThis is a joint work with V. Calvez and F. Débarre. \n DTSTART:20190314T150000 DTEND:20190314T160000 LOCATION:Salle B407\, bâtiment B\, LAGA\, Institut Galilée\, Université Par is 13GGé SUMMARY:Predator—prey systems\, Allee effect &\; application to a gene d rive reversal model END:VEVENT BEGIN:VEVENT UID:20230626T154011CEST-1406NLVFcm@mb-1.laga.fr DTSTAMP:20230626T134011Z CATEGORIES:SEMINAIRE MB DESCRIPTION:Florence Débarre\n \n DTSTART:20190314T140000 DTEND:20190314T150000 LOCATION:Salle B407\, bâtiment B\, LAGA\, Institut Galilée\, Université Par is 13GGé SUMMARY:Evaluating control measures to stop an ongoing gene drive END:VEVENT BEGIN:VEVENT UID:20230626T154011CEST-1421F30e8T@mb-1.laga.fr DTSTAMP:20230626T134011Z CATEGORIES:SEMINAIRE MB DESCRIPTION:Nicolas Vauchelet\n \n DTSTART:20190314T110000 DTEND:20190314T123000 LOCATION:Salle B407\, bâtiment B\, LAGA\, Institut Galilée\, Université Par is 13GGé SUMMARY:Parabolic models in population dynamics\, 3eme séance du cours de l 'École Doctorale "\;Biological phenomena : description\, modelling and mathematical approach END:VEVENT BEGIN:VEVENT UID:20230626T154011CEST-1472xUvftl@mb-1.laga.fr DTSTAMP:20230626T134011Z CATEGORIES:SEMINAIRE MB DESCRIPTION:Pierre-Alexandre Bliman \n \n \n \n DTSTART:20190221T150000 DTEND:20190221T160000 LOCATION:Salle B407\, bâtiment B\, LAGA\, Institut Galilée\, Université Par is 13GGé SUMMARY:Control Strategies for Sterile Insect Techniques END:VEVENT BEGIN:VEVENT UID:20230626T154011CEST-1479UnnR9B@mb-1.laga.fr DTSTAMP:20230626T134011Z CATEGORIES:SEMINAIRE MB DESCRIPTION:Anton Camacho \n\n\n \n \n \n &\;lt\;style type="\;text/ css"\;&\;gt\;p { margin-bottom: 0.25cm\; direction: ltr\; line-heig ht: 120%\; text-align: left\; }&\;lt\;/style&\;gt\;\n\n\n\n \n\n\nKey words DTSTART:20190221T140000 DTEND:20190221T150000 LOCATION:Salle B407\, bâtiment B\, LAGA\, Institut Galilée\, Université Par is 13GGé SUMMARY:Unravelling the association between precipitation and transmission of waterborne pathogens END:VEVENT BEGIN:VEVENT UID:20230626T154011CEST-1502CpSA02@mb-1.laga.fr DTSTAMP:20230626T134011Z CATEGORIES:SEMINAIRE MB DESCRIPTION:Nicolas Vauchelet Ce second cours sera consacré à l'introductio n de\n quelques modèles compartimentaux très utilisés en épidémiologi e\n mathématique. Après avoir rappelé les concepts mathématiques de\n base et résultats indispensables sur les systèmes différentiels\,\n nous introduirons des modèles mathématiques classiques en\n épid émiologie et expliquerons comment caractériser les épidémies\n en cal culant le nombre de reproduction de base. DTSTART:20190221T110000 DTEND:20190221T123000 LOCATION:Salle B407\, bâtiment B\, LAGA\, Institut Galilée\, Université Par is 13GGé SUMMARY:"\;Mathematical epidemiology"\;\, 2eme séance du cours de l 'École Doctorale "\;Biological phenomena : description\, modelling and mathematical approach."\; END:VEVENT BEGIN:VEVENT UID:20230626T154011CEST-158183Amhg@mb-1.laga.fr DTSTAMP:20230626T134011Z CATEGORIES:SEMINAIRE MB DESCRIPTION:Nicolas Bacaer Pour un environnement aléatoire\, on montre avec la\n méthode BKW que le temps moyen d'extinction dans le modèle\n épidémique SIS surcritique croît avec la taille de la population\n soit comme une loi exponentielle\, soit comme une loi de puissance.\n Dans le même environnement mais avec un processus de naissance et\n de mort linéaire et sous-critique\, il existe une formule explicite\n pour le taux d'extinction \; on cherche le lien avec le système\n d 'équations aux dérivées partielles vérifié par les fonctions\n généra trices. Pour un environnement périodique\, on présente\n quelques dév eloppements récents concernant la taille finale d’une\n épidémie déte rministe de type SIR. Dans le cas d'un environnement\n constant\, on ajoute quelques remarques concernant la probabilité\n d'extinction po ur des processus de naissance et de mort à\n plusieurs types. On s'in téresse enfin à un système homogène\n d'équations différentielles pou r la transition démographique. Il\n sera aussi question de l'utilisat ion de la traduction automatique\n dans la recherche scientifique. DTSTART:20190207T150000 DTEND:20190207T160000 LOCATION:Salle B407\, bâtiment B\, LAGA\, Institut Galilée\, Université Par is 13GGé SUMMARY:Quelques modèles de population dans des environnements variables END:VEVENT BEGIN:VEVENT UID:20230626T154011CEST-1595OT61wu@mb-1.laga.fr DTSTAMP:20230626T134011Z CATEGORIES:SEMINAIRE MB DESCRIPTION:Clara Champagne The dengue virus is expanding worldwide and mod elling its dynamics\n can help to better understand\, predict and con trol its\n propagation. However\, this mosquito-borne disease is infl uenced by\n a multiplicity of human and environmental factors that ar e complex\n to include in parsimonious epidemiological models. In par allel\,\n statistical and computational tools are nowadays available to\n confront theoretical models to the observed data. In this work\, we\n study and compare dengue propagation models in the light of dat a.\n Firstly\, using data from the Kampong Cham region in Cambodia\, we\n compare several dengue models that incorporate increasing\n complexity both in the details of disease life history and in the\n account for stochasticity. Secondly\, we explore other aspects of\n t ransmission\, such as seasonality and spatial structure\, in the\n ca se of dengue epidemics in Rio de Janeiro (Brazil). \n DTSTART:20190207T140000 DTEND:20190207T150000 LOCATION:Salle B407\, bâtiment B\, LAGA\, Institut Galilée\, Université Par is 13GGé SUMMARY:Mathematical modelling and statistical inference to better understa nd dengue dynamics END:VEVENT BEGIN:VEVENT UID:20230626T154011CEST-1602hXb7FU@mb-1.laga.fr DTSTAMP:20230626T134011Z CATEGORIES:SEMINAIRE MB DESCRIPTION:Nicolas Vauchelet\n \n DTSTART:20190207T110000 DTEND:20190207T123000 LOCATION:Salle B407\, bâtiment B\, LAGA\, Institut Galilée\, Université Par is 13GGé SUMMARY:Cours de l'École Doctorale "\;Biological phenomena : descriptio n\, modelling and mathematical approach."\; (Lecture 1 : Generalities and Modeling). END:VEVENT BEGIN:VEVENT UID:20230626T154011CEST-1755OBKVZ9@mb-1.laga.fr DTSTAMP:20230626T134011Z CATEGORIES:SEMINAIRE MB DESCRIPTION:Shensi Shen Acquisition \nby cancer cells of a plethora of resi stance-conferring genetic \nalterations greatly limits the clinical utilit y of most anti- cancer \ndrugs. Therefore\, there is a need to improve the effective- ness of \ntreatment before mutational-acquired resistance prev ails. Relapse is \ndriven by a small subpop- ulation of residual or “drug- tolerant” cells\, \nwhich are traditionally called “minimal residual disea se” (MRD)\, that \nremain viable upon drug exposure. Recent in vitro findi ngs have \nindicated that the emergence of these per- sisters is unlikely due to \nmutational mechanisms. A non-mutually exclusive scenario proposes that \nthe drug-tolerant phenotype is transiently acquired by a small pro - \nportion of cancer cells through non-mutational mechanisms. To gain \ni nsights into the biology of MRD\, we applied single-cell RNA sequencing \n to malignant melanoma BRAF mutated cells\, and we identified a \nsubpopula tion of melanoma cells is tolerant to targeted therapy via \nmetabolic rep rogramming. Cancer cells were known to reprogram their \nmetabolic profile s geared toward glycolysis\, despite sufficient oxy- gen\n available to su pport oxidative phosphorylation (OXPHOS)\, a phenomenon \nknown as the War burg effect. We found that melanoma MRD can switch their\n metabolic progr am from glycolysis towards mitochondrial OXPHOS \nalimented by fatty acid oxidation (FAO)\, thereby renders the melanoma \nMRD highly sensitive to F AO inhibition in vitro and in mouse tumor \nmodels. This MRD-directed meta bolic reprogramming suggests a more clever\n treatment combination regimen to fight against cancer resistance. DTSTART:20190111T150000 DTEND:20190111T160000 LOCATION:Salle B405\, bâtiment B\, LAGA\, Institut Galilée\, Université Par is 13GGé SUMMARY:Targeting minimal residual disease in melanoma END:VEVENT BEGIN:VEVENT UID:20230626T154011CEST-1770XdV2v4@mb-1.laga.fr DTSTAMP:20230626T134011Z CATEGORIES:SEMINAIRE MB DESCRIPTION:Diane Peurichard In this \ntalk\, we investigate the multi-scal e link for a model of tumor growth. \nWe start from a microscopic model wh ere cells are modelled as 2D spheres\n undergoing short range repulsion an d cell division. We derive the \nassociated macroscopic dynamics leading t o a porous media type equation.\n As the macroscopic equation obtained thr ough usual derivation method \nfails at providing the correct qualitative behavior\, we propose a \nmodified version of the macroscopic equation int roducing a density \nthreshold for the repulsion. We numerically validate the new formulation\n by comparing the solutions of the micro- and macro- dynamics. Moreover\,\n we study the asymptotic behavior of the dynamics as the repulsion \nbetween cells becomes singular (leading to non-overlappin g constraints \nin the microscopic model). We show formally that such asym ptotic limit \nleads to a Hele-Shaw type problem for the macroscopic dynam ics. The \nnumerical simulations reveal an excellent agreement between the micro- \nand macro- descriptions\, validating the formal derivation of th e \nmacroscopic model. The macroscopic model derived here therefore enable s \nto overcome the problem of large computational time raised by the \nmi croscopic model\, but stays closely linked to the microscopic dynamics. DTSTART:20190111T140000 DTEND:20190111T150000 LOCATION:Salle B405\, bâtiment B\, LAGA\, Institut Galilée\, Université Par is 13GGé SUMMARY:Multi-scale approach for a model of tumor growth: from short-range repulsion to Hele-Shaw problems END:VEVENT BEGIN:VEVENT UID:20230626T154011CEST-1900jkSC9c@mb-1.laga.fr DTSTAMP:20230626T134011Z CATEGORIES:SEMINAIRE MB DESCRIPTION:Vuk Milisic\n After an introduction of the adhesion modeling in the FBLM\, we present a hierarchy of problems&\;nbsp\;set up in order to gradually understand various mathematical aspects of this approach.& \;nbsp\;We end up with the latest results obtained in the context of non-l inear parabolic equations.&\;nbsp\;To finish\, we present a conjecture and an open problem. DTSTART:20181130T150000 DTEND:20181130T160000 LOCATION:Salle B405\, bâtiment B\, LAGA\, Institut Galilée\, Université Par is 13GGé SUMMARY:Mathematical analysis of adhesion mechanisms in the context of cell motility : an overview END:VEVENT BEGIN:VEVENT UID:20230626T154011CEST-19146pvuKm@mb-1.laga.fr DTSTAMP:20230626T134011Z CATEGORIES:SEMINAIRE MB DESCRIPTION:Christian Schmeiser\n Two mathematical modeling projects will b e presented:&\;nbsp\;1) the Filament Based Lamellipodium Model (FBLM)\, a two-dimensional\, two-phase\, anisotropic continuum model for the dynam ics of the actin filament network in the lamellipodium\, a motility organe lle of many cell types\, and&\;nbsp\;2) a recent phenomenological model for the adhesion free migration of leukocytes\, based on a&\;nbsp\;mod el for the dynamics of the cell cortex. DTSTART:20181130T140000 DTEND:20181130T150000 LOCATION:Salle B405\, bâtiment B\, LAGA\, Institut Galilée\, Université Par is 13GGé SUMMARY:Actin Driven Cell Motility: Lamellipodium Treadmilling and Cortical Flow END:VEVENT BEGIN:VEVENT UID:20230626T154011CEST-2277du9Nwj@mb-1.laga.fr DTSTAMP:20230626T134011Z CATEGORIES:SEMINAIRE MB DESCRIPTION:Safaa Al Ali Il s'agit de la soutenance de mémoire de M2 pour S afaa. Les maladies inflammatoires chroniques de l’intestin (MICI) sont des \ninflammations de la paroi intestinale\, résultant d’une réponse excessiv e\n des défenses naturelles du système immunitaire.\n \nDans ce stage\, on s’intéresse au diagnostic automatique de la \nrectocolite hémorragique (RC H) d'après les vidéos obtenues lors d'une \nendoscopie du colon. Nous prés enterons une étude des scores \nendoscopiques utilisés pour l’évaluation d e la sévérité de la maladie\, \nainsi qu'un score simplifié implémenté dur ant le stage. Ensuite\, nous \nproposons une nouvelle visualisation des lé sions (saignements et \nulcères) permettant au médecin de mieux localiser leur emplacement le \nlong de la paroi intestinale. Enfin\, nous étudions l'aspect des \nsaignements dans les vidéos\, et comparons plusieurs modèle s de couleur \ndes patchs observés. \n DTSTART:20180928T150000 DTEND:20180928T160000 LOCATION:Salle B405\, bâtiment B\, LAGA\, Institut Galilée\, Université Par is 13GGé SUMMARY:Modélisation des lésions de l’intestin dans les vidéos endoscopique s END:VEVENT BEGIN:VEVENT UID:20230626T154011CEST-2293aFTlmP@mb-1.laga.fr DTSTAMP:20230626T134011Z CATEGORIES:SEMINAIRE MB DESCRIPTION:Aline Criton et Guillaume Trébuchet\n \n DTSTART:20180928T140000 DTEND:20180928T150000 LOCATION:Salle B405\, bâtiment B\, LAGA\, Institut Galilée\, Université Par is 13GGé SUMMARY:Probe-based Confocal Laser Endomicroscopy (pCLE) in the management of inflammatory bowel diseases END:VEVENT BEGIN:VEVENT UID:20230626T154011CEST-2578CSl8W6@mb-1.laga.fr DTSTAMP:20230626T134011Z CATEGORIES:SEMINAIRE MB DESCRIPTION:Jean-Pierre Hugot La\n peste a sévi en Europe depuis le 14ème s iècle et jusqu'au 19ème siécle.\n Elle a été un des plus importants chocs démographiques au moment de la \npeste noire\n au 14ème siècle. Il semble donc légitime de recehercher aujourd'hui une\n empreinte génétique de cett e pandémie.\nLe\n gène NOD2 est impliqué dans le réponse immunitaire innée . Ceratines \nmutations\, associées à la maladie de Crohn (MC) ne se renco ntrent que \ndans les populations\n européennes où une sélection naturelle avec avantage à l'hétérozygote \nest fortement suspectée. Nous avons mont ré par ailleurs que ces \nmutations améliorent la survie des souris infect ées par Yersinia \npseudotuberculois\, une bactérie entéropathogène proche de\n Yersinia pestis.\nDans\n ce travail\, nous montrons que la fréquence des mutations de NOD2 dans \nles populations modernes d'Europe et du bass in méditérannéen sont \nassociées à l'intensité\n des épidémies de peste u rbaine au long de l'histoire. Cette association\n reste significative si o n tient compte des migrations ou de la taille \ndes villes atteintes.\nIl \n est donc possible que les mutations NOD2 aient eu un avantage sélectif \nau moment des épidémies de peste en Europe\, favorisant la persistance d e\n mutations\,\n aujourd'hui délétères car associées à la MC. DTSTART:20180608T143000 DTEND:20180608T150000 LOCATION:Amphi 1\, Fac de médecine de l'Hôpital BichatGGé SUMMARY: La maladie de Crohn est-elle le prix à payer pour avoir survécu à la peste noire? END:VEVENT BEGIN:VEVENT UID:20230626T154011CEST-25856bvPhC@mb-1.laga.fr DTSTAMP:20230626T134011Z CATEGORIES:SEMINAIRE MB DESCRIPTION:Alberto Romagnoni La prédiction des maladies à partir des donné es génomiques d'une \npersonne est la question clé de la génétique cliniqu e. Si cette question\n a une solution simple pour les maladies mendélienne s\, il n'a pas été \npossible d'y répondre pour les maladies génétiques co mplexes à cette \ndate. \nLes techniques de machine learning sont des métho des nouvelles et très \npuissantes pour analyser des données complexes tel les que les données \ngénomiques. \nNous avons appliqué différentes approch es incluant des régression \nlogistiques pénalisées\, des arbres et des ré seaux de neurones aux \ndonnées génétiques issues d'un consortium internat ional sur la maladie \nde Crohn (52.000 cas et contrôles génotypés pour 15 0.000 marqueurs \nSNP). \nNous avons pu montré que les méthodes de pré-proc essing du jeu de \ndonnées avait une influence importante sur les résultat s obtenus avec \nune augmentation artificielle des capacités de classifica tion des \ndiverses méthodes. \nLes approches\, bien que différentes\, ont donné des résultats \nsensiblement similaires avec des Aires sous la courb e (AUC) ROC égales à\n 0.8. \nCes résultats\, bien qu'importants ne permet tent cependant pas une \napplication clinique fiable et posent la question de la manière \nd'augmenter notre capacité de prédire une maladie complex e à partir des \ndonnées génomiques. \n DTSTART:20180608T140000 DTEND:20180608T143000 LOCATION:Amphi 1\, Fac de médecine de l'Hôpital BichatGGé SUMMARY:Comparative performances of machine learning methods to classify Cr ohn Disease patients using a genome-wide genotyping dataset END:VEVENT BEGIN:VEVENT UID:20230626T154011CEST-2593T8npOe@mb-1.laga.fr DTSTAMP:20230626T134011Z CATEGORIES:SEMINAIRE MB DESCRIPTION:Xavier Tréton La rectocolite hémorragique (RCH) est une maladie multifactorielle \nhétérogène. Les patients qui en souffrent ont des prof ils évolutifs et \ndes réponses individuelles aux traitements existants qu i varient. La \nprédiction de ces différentes réponses semble possible\, m ais nécessite \ndes regroupements d'individus selon des signatures biologi ques \ncomplexes. L'exposé fera un état de l'utilisation des data biologiq ues \npermettant de prédire l'évolution de la maladie\, et présentera un p rojet\n du groupe visant à établir des outils de médecine personnalisée po ur la\n RCH\, impliquant une intégration des données. DTSTART:20180608T133000 DTEND:20180608T140000 LOCATION:Amphi 1\, Fac de médecine de l'Hôpital BichatGGé SUMMARY:vers une médecine prédictive dans une maladie complexe multi-factor ielle: l'exemple de la rectocolite hémorragique END:VEVENT BEGIN:VEVENT UID:20230626T154011CEST-2601mB7PG5@mb-1.laga.fr DTSTAMP:20230626T134011Z CATEGORIES:SEMINAIRE MB DESCRIPTION:Antonio Cosma Flow cytometry based single cell technologies wer e effective in \nmonitoring CD4 T-cell decay from the early beginning of H IV-1 epidemic \nand successively became a key technology to gain insight i nto the role \nof different cell types in disease progression and pathogen esis. \nRecently\, mass cytometry\, also named Cytometry by Time of Flight \n(CyTOF)\, augmented the number of molecules detected per single cell \n revealing a surprisingly multidimensional nature of the immune cells. A \n major consequence of the increase of the detectable molecules per single\n cell is the shift of cytometry from a hypothesis driven to a hypothesis\n generating technology. In a hypothesis generating setting\, we evaluated \n the phenotype and function of whole blood cells in a group of chronic \nHIV-1 infected individuals with controlled and uncontrolled viral \nrepl ication. In the context of this study\, we developed an analysis \nworkflo w for the exploration of multidimensional data\, applicable not \nonly to flow and mass cytometry data\, but also to any multidimensional \ndataset. The workflow combines the use of different automated \nclustering\, dimen sionality reduction and visualization methods all \ncentered on the key co ncept to let the scientist exploring the dataset \nwithout the interventio n of an IT specialist. The study of the HIV-1 \ninfected individuals by ma ss cytometry combined with our method of \nanalysis revealed an unexpected phenotypic diversity of the innate \nimmune system and opened the way to further functional investigations. DTSTART:20180608T130000 DTEND:20180608T133000 LOCATION:Amphi 1\, Fac de médecine de l'Hôpital BichatGGé SUMMARY:Multidimensional view of the innate immune system in HIV-1 infected individuals END:VEVENT BEGIN:VEVENT UID:20230626T154011CEST-2848rte9Fa@mb-1.laga.fr DTSTAMP:20230626T134011Z CATEGORIES:SEMINAIRE MB DESCRIPTION:Vincent Lorent La larve du fourmilion Euroleon nostras (insecte névroptère) se présente\n sous la forme d'un corps ovoïde de la taille d' un ongle du petit doigt.\n Le pourtour de son abdomen est pourvu de toupet s de cils d'un \nmillimètre de longueur. Ces cils sont identifiés comme de s \nmécano-senseurs ayant leur utilité pour la détection de proies \n(géné ralement des fourmis). 10% &\;nbsp\;des fourmilions\, des 1500 &\;nb sp\;répertoriées\n à ce jour\, adoptent un comportement de chasseur à l’af fût. Le \nfourmilion vit dans des sols sableux. Il y creuse un piège en fo rme \nd'entonnoir et y attend l'arrivée de sa proie. Lorsque celle-ci s'es t \naventurée dans l'entonnoir et tente de rebrousser chemin\, le fourmili on \nlui projette du sable et précipite sa chute. La proie est éventuellem ent\n saisie. L'objet de cette étude est de déterminer\, par les \nréponses comportementales du fourmilion à des prodromes vibratoires\, la \ncapacit é qu'a développé ce dernier à saisir un signal de faible \namplitude trans mis par la propagation d'une onde dans un milieu \ngranulaire. Il a ainsi été démontré que le fourmilion est sensible à des\n vibrations d'amplitude de l'ordre du dixième de nanomètre\, si ces \nvibrations sont interprétée s comme la manifestation de la présence d'une\n proie. Dans ce séminaire\, j'expliquerai l'apport de cette étude\n à ce que l'on sait des performanc es sensorielles de cet arthropode.&\;nbsp\; Je\n développerai également une approche par la physique et le traitement du\n signal aux questions c oncernant sa reconnaissance supposée de motifs \nvibratoires. DTSTART:20180413T150000 DTEND:20180413T160000 LOCATION:Salle B405\, bâtiment B\, LAGA\, Institut Galilée\, Université Par is 13GGé SUMMARY:Une étude physique des performances mécano-sensorielles du fourmili on Euroleon nostras END:VEVENT BEGIN:VEVENT UID:20230626T154011CEST-2869A1bxvX@mb-1.laga.fr DTSTAMP:20230626T134011Z CATEGORIES:SEMINAIRE MB DESCRIPTION:Andrea Perna (english abstract below) Plusieurs espèces d'animau x modifient environnement en \nconstruisant des structures spatiales qu'il s utilisent pour protection \n(par exemple les nids d'oiseaux) ou pour cap turer des proies (par \nexemple les pièges des fourmilions). Il est cepend ant\n seulement chez les insectes sociaux\, comme par exemple les fourmis et \nles termites\, que l'on trouve les structures les plus complexes: rés eaux\n de sentiers qui s'étalent sur plusieurs mètres de longueur\, nids a ux \narchitectures complexes.\nDans mon exposé\, je résumerai ce qui est c onnu sur les mécanismes de construction au niveau individuel\, allant de l a perception\n sensorielle aux interactions entre individus. J'essayerai e nsuite \nd'aborder la question du comment les differentes\n formes de nids et de réseaux de pistes observés en milieu naturel \npourraient être prod uites à partir de ces règles d’interaction simples.\n\n\nVarious animal sp ecies build spatial structures that they \nuse as a shelter (e.g. bird nes ts) or as traps (e.g. myrmelion traps). \nAmong these structures\, the lar gest and most complex are those produced \nby social insects such as ants and termites:\n newtorks of trails spanning several metres\, large nests w ith complex \narchitecture. In my talk\, I will summarise some established knowledge \nabout the individual-level building mechanisms\, from sensory perception \nto inter-individual interactions. I will then\n address the question\, how do different shapes of nests and foraging \ntrails emerge f rom the empirically observed interaction rules? DTSTART:20180413T140000 DTEND:20180413T150000 LOCATION:Salle B405\, bâtiment B\, LAGA\, Institut Galilée\, Université Par is 13GGé SUMMARY:Comment les fourmis parviennent-elles à construire leur nid? À la r echerche de liens entre perception individuelle et formes de la morphogenè se collective. END:VEVENT BEGIN:VEVENT UID:20230626T154011CEST-31193C6SNW@mb-1.laga.fr DTSTAMP:20230626T134011Z CATEGORIES:SEMINAIRE MB DESCRIPTION:John Chaussard\n \n DTSTART:20180316T140000 DTEND:20180316T153000 LOCATION:Salle B405\, bâtiment B\, LAGA\, Institut Galilée\, Université Par is 13GGé SUMMARY:Initiation au traitement d'images à l'aide de la méthodes morpholog iques END:VEVENT BEGIN:VEVENT UID:20230626T154011CEST-3419wvlefl@mb-1.laga.fr DTSTAMP:20230626T134011Z CATEGORIES:SEMINAIRE MB DESCRIPTION:Amic Frouvelle\n DTSTART:20180119T140000 DTEND:20180119T150000 LOCATION:Salle B405\, bâtiment B\, LAGA\, Institut Galilée\, Université Par is 13GGé SUMMARY:Alignement de particules autopropulsées : modèles cinétiques et mac roscopiques END:VEVENT BEGIN:VEVENT UID:20230626T154011CEST-4396uG0XUx@mb-1.laga.fr DTSTAMP:20230626T134011Z CATEGORIES:SEMINAIRE MB DESCRIPTION:Pierre Gabriel\n DTSTART:20171110T140000 DTEND:20171110T150000 LOCATION:Salle B405\, bâtiment B\, LAGA\, Institut Galilée\, Université Par is 13GGé SUMMARY:"\;Leaky Integrate-and-fire"\; END:VEVENT BEGIN:VEVENT UID:20230626T154011CEST-4903jOtXZI@mb-1.laga.fr DTSTAMP:20230626T134011Z CATEGORIES:SEMINAIRE MB DESCRIPTION:J. Ignacio Tello We consider a mathematical model of distributi on of morphogens \n(signaling molecules responsible for the differentiatio n of cells and \nthe creation of tissue patterns). The model was proposed by Lander\, Nie \nand Wan in 2002 and it&\;nbsp\; consists of a system of two equations: a PDE of \nparabolic type modeling the distribution of f ree morphogens with a \ndynamic boundary condition and an ODE describing t he evolution of bound \nreceptors. Three biological processes are taken in to account: diffusion\,\n degradation and reversible binding. We prove exi stence and uniqueness \nof solutions and its asymptotic behavior. \n DTSTART:20170505T150000 DTEND:20170505T160000 LOCATION:Salle B405\, bâtiment B\, LAGA\, Institut Galilée\, Université Par is 13GGé SUMMARY:On a mathematical model of Morphogenesis END:VEVENT BEGIN:VEVENT UID:20230626T154011CEST-4919VTTnoX@mb-1.laga.fr DTSTAMP:20230626T134011Z CATEGORIES:SEMINAIRE MB DESCRIPTION:Cécile Carrère Pour éviter l'apparition de cellules cancéreuses résistantes à une\n chimiothérapie\, beaucoup de protocoles imposent d e fortes doses de\n médicament : la dose maximale tolérée par le patien t (MTD). Dans une\n série d'expériences in vitro menées par M.Carré au laboratoire du\n CRO2 à la Timone\, Marseille\, la présence de cellules résistantes dès\n le début du traitement fait échouer ce protocole\, a lors que\n l'utilisation de plus faibles doses permet de contrôler la t aille de\n la tumeur. Afin d'expliquer et d'optimiser ce phénomène\, G. Chapuisat\n a développé un modèle simple EDO reproduisant les résultats de ces\n expériences. L'analyse du plan de phase de ce système\, et\n l'utilisation de la théorie du contrôle optimal\, permettent alors de\n déterminer des protocoles de traitements efficaces pour réduire la\n tumeur à une taille minimale. Afin de prendre en compte\n l'organisat ion spatiale des cellules\, nous avons ensuite étudié un\n modèle EDP d e compétition-diffusion de deux espèces dans un milieu\n favorable. Enf in\, en collaboration avec H.Zidani\, nous développons\n des méthodes d 'optimisation numérique pour contrôler la taille de la\n tumeur au cour s du temps. \n DTSTART:20170505T140000 DTEND:20170505T150000 LOCATION:Salle B405\, bâtiment B\, LAGA\, Institut Galilée\, Université Par is 13GGé SUMMARY:Prise en compte de la résistance à la chimiothérapie dans l'optimis ation de traitements END:VEVENT BEGIN:VEVENT UID:20230626T154011CEST-5021vZX8TP@mb-1.laga.fr DTSTAMP:20230626T134011Z CATEGORIES:SEMINAIRE MB DESCRIPTION:Etienne Birmelé\n \n DTSTART:20170421T141500 DTEND:20170421T150000 LOCATION:Salle B405\, bâtiment B\, LAGA\, Institut Galilée\, Université Par is 13GGé SUMMARY:Etude de la dérégulation dans l'expression de gènes END:VEVENT BEGIN:VEVENT UID:20230626T154011CEST-50288u9Iz4@mb-1.laga.fr DTSTAMP:20230626T134011Z CATEGORIES:SEMINAIRE MB DESCRIPTION:François Radvanyi\n DTSTART:20170421T133000 DTEND:20170421T141500 LOCATION:Salle B405\, bâtiment B\, LAGA\, Institut Galilée\, Université Par is 13GGé SUMMARY:De l'analyse des données à large échelle des cancers aux applicatio ns cliniques END:VEVENT BEGIN:VEVENT UID:20230626T154011CEST-5337pUOFRA@mb-1.laga.fr DTSTAMP:20230626T134011Z CATEGORIES:SEMINAIRE MB DESCRIPTION:Anton Camacho et Nicolas Vauchelet \n \nMoving on to the recent Ebola virus disease outbreak in West Africa\, I will present how we devel oped real-time modelling and forecasting tools for monitoring the evolutio n of the epidemic and informing the design of appropriate interventions. D ue to limited data available in real-time\, it was challenging to explain the dynamics of Ebola transmission as a mechanistic interplay between diff erent factors. To tackle this issue\, we used a stochastic SEIR model with a phenomenological approach for the transmission rate\, which was modelle d as a Brownian motion. I will close with a retrospective assessment of ou r forecasts in term of reliability\, sharpness and bias.Title: Mathematica l modeling of the spread of Wolbachia for Dengue control.Abstract: In the fight against world-wide plague of dengue and of other arboviruses\, innov ative vector-control techniques have been developed. Among them\, the use of bacteria Wolbachia has received considerable attention. In fact\, this maternally transmitted bacteria blocks the transmission of some arboviruse s from mosquitoes to human. Therefore\, releases of Wolbachia infected mos quitoes are performed in the aim that the infected population\, unable to transmit diseases\, replace the host population. In this talk\, we will co nsider the modeling and a mathematical study of the spread of this bacteri a into a host population. It boils down to study the traveling waves for s ome reaction-diffusion model and the conditions to ignite the propagation. \n DTSTART:20170303T140000 DTEND:20170303T153000 LOCATION:Salle B405\, bâtiment B\, LAGA\, Institut Galilée\, Université Par is 13GGé SUMMARY:Mathematical modeling of the spread of Wolbachia for Dengue control END:VEVENT BEGIN:VEVENT UID:20230626T154011CEST-5367wIuMLb@mb-1.laga.fr DTSTAMP:20230626T134011Z CATEGORIES:SEMINAIRE MB DESCRIPTION:Amandine Aftalion\n Le but de l'exposé est d'expliquer\, avec d es équations différentielles\, comment l'effort humain s'organise pour cou rir et produire la meilleure performance. Les physiologistes savent\, d'ap rès l'expérience\, qu'une course de durée inférieur à 3mn se courent avec une très forte accélération initiale\, puis une décélération\, tandis que les courses supérieures à 3mn se courent avec un sprint final. Ceci peut ê tre expliqué et justifié grâce à un système d'équations différentielles co uplant la vitesse\, l'énergie anaérobie et la force de propulsion\, tout e n prenant en compte les sources d'énergie aérobie via la VO2. Nous expliqu erons le modèle\, les preuves sur la structure de la solution optimale et illustrerons la théorie avec des simulations numériques de champions sur d es 100m\, 400m\, 800m et 1500m pour vérifier que le modèle décrit bien la réalité. &\;nbsp\;&\;nbsp\; DTSTART:20170224T140000 DTEND:20170224T150000 LOCATION:Salle B405\, bâtiment B\, LAGA\, Institut Galilée\, Université Par is 13GGé SUMMARY:Du 100 mètres au 1500 mètres: comment les maths nous aident à couri r? END:VEVENT BEGIN:VEVENT UID:20230626T154011CEST-57057vWuSu@mb-1.laga.fr DTSTAMP:20230626T134011Z CATEGORIES:SEMINAIRE MB DESCRIPTION:Jonathan Touboul et Jérôme Ribot\n The brain contains the repre sentation of sensory features that is organized into maps with specific ge ometrical properties. The primary visual cortex is the first cortical step for the processing of vision. It contains multiple maps specific to the o rientation of a stimulus\, the direction of a movement\, or the location i n visual space. These maps originate from subcortical inputs as well as in tracortical connectivity. In this talks\, we will present new data concern ing their topology\, their origin\, as well as their role in visual percep tion. Two specific issues will be treated:the role of the corpus callosum (the structure connecting the two hemispheres) in visual perception and ma p formation (J. Ribot\, Collège de France)the topology of the spatial freq uency map\, its impact on visual perception and what it tells us on the ma thematical principles that govern these architectures (J. Touboul\, Inria &\;amp\; Collège de France) DTSTART:20161209T140000 DTEND:20161209T153000 LOCATION:Salle B405\, bâtiment B\, LAGA\, Institut Galilée\, Université Par is 13GGé SUMMARY:Functional maps in the primary visual cortex: new data and models END:VEVENT BEGIN:VEVENT UID:20230626T154011CEST-7150hb7bCV@mb-1.laga.fr DTSTAMP:20230626T134011Z CATEGORIES:SEMINAIRE MB DESCRIPTION:Olivier Lafitte\n DTSTART:20160513T150000 DTEND:20160513T160000 LOCATION:Salle B405\, bâtiment B\, LAGA\, Institut Galilée\, Université Par is 13GGé SUMMARY:Une modélisation des contraintes mécaniques dans les cerveaux de pe rsonnes souffrant de la maladie d'alzheimer. END:VEVENT BEGIN:VEVENT UID:20230626T154011CEST-716517snEp@mb-1.laga.fr DTSTAMP:20230626T134011Z CATEGORIES:SEMINAIRE MB DESCRIPTION:Marcel Levy\n DTSTART:20160513T140000 DTEND:20160513T150000 LOCATION:Salle B405\, bâtiment B\, LAGA\, Institut Galilée\, Université Par is 13GGé SUMMARY:Comparaison entre les sujets souffrant de la maladie d'alzheimer et les sujets normaux âgés: analyse de la bibliographie et recherche des don nées en vue de proposer une modélisation END:VEVENT BEGIN:VEVENT UID:20230626T154011CEST-7441ZszvuB@mb-1.laga.fr DTSTAMP:20230626T134011Z CATEGORIES:SEMINAIRE MB DESCRIPTION:José Faro Our quantitative knowledge on how T-cells recognize f oreign peptides is based on the determination of the strength of interacti on between T-cell receptors (TCR) and their ligands (peptides bound to maj or histocompatibility complex molecules [pMHC]). This determination has re lied on classical experimental assays in which pMHC and/or TCRs are placed in solution (3D assays). However\, classification of T-cell ligands acco rding to their 3D strength of interaction to TCRs was often inconsistent w ith the biological outcome of that interaction.\nTwo landmark papers in 20 10 disclosed essential differences between classical\, 3D assays and assay s in which TCRs and their pMHC ligands are confined into a membrane (2D as says)\, revealing a large impact of dimensionality in the kinetics of thos e reversible chemical reactions: 2D on-rates appear to be\, ultimately\, r esponsible for the differences in the ligand potency. This suggests\, ther efore\, that 2D experiments are mandatory in order to understand TCR-media ted T cell activation.\nHowever\, there is a lack of convincing first prin ciple explanations of the empirical differences between 2D and 3D experime nts. Is it possible to reconcile the whole body of knowledge accumulated i n the last two decades regarding kinetic parameters of TCR-pMHC interactio ns? DTSTART:20160325T150000 DTEND:20160325T160000 LOCATION:Salle B405\, bâtiment B\, LAGA\, Institut Galilée\, Université Par is 13GGé SUMMARY:Estimating the real kinetics of TCR-pMHC interactions in living cel ls END:VEVENT BEGIN:VEVENT UID:20230626T154011CEST-7456FZxPeg@mb-1.laga.fr DTSTAMP:20230626T134011Z CATEGORIES:SEMINAIRE MB DESCRIPTION:Nadine Varin Chronic lymphocytic leukemia is a clonal B cell ma lignancy of the elderly. This neoplasm is characterized by a heterogeneous clinical course from indolent chronic disease to rapidly evolutive lympha denopathy still incurable. Recent analyses using whole genome sequencing h ave uncovered several early mutations or deletions indicative of a risk of clonal progression. However\, the most discriminative pathophysiological marker of the illness remains the mutational status of the IGHV gene expre ssed at the membrane within the B cell immune receptor (BCR). Presence of unmutated genes is correlated with progression and poor outcome of the pat ient. \nWe have previously shown that B Cell Receptor (BCR)-mediated pathw ays are essential to the survival of malignant B-cells and to their infilt ration within lymph nodes determining disease progression. We addressed in this study the presence of subclonal B cell populations and their differe ntial phenotypic and functional features.\n\nOur results indicate the pres ence in various extents of B cell subpopulations able to express specific regulatory cytokines and factors. Moreover\, we identified a subpopulation producing all these factors concurrently and we proved their regulatory f unction in coculture experiments with T cells from the same patients. We p erformed a hierarchical classification of these factors and challenged thi s hierarchy to cluster phenotypic cell populations and patients. Phenotypi cally\, these cells expressed activation and memory B cells markers. Final ly\, expression of the regulatory factors was correlated to the IGHV mutat ional status with a biased repertoire and to progressive outcome of the pa tient. DTSTART:20160325T140000 DTEND:20160325T150000 LOCATION:Salle B405\, bâtiment B\, LAGA\, Institut Galilée\, Université Par is 13GGé SUMMARY:CLL B cells have a heterogeneous signalling profile linked to their regulatory properties: hierarchical classification of the factors before clustering of patient outcome END:VEVENT BEGIN:VEVENT UID:20230626T154011CEST-8610BANvk3@mb-1.laga.fr DTSTAMP:20230626T134011Z CATEGORIES:SEMINAIRE MB DESCRIPTION:Vincent Calvez Je présenterai un modèle continu en temps/âge/ph énotype pour l'évolution d'une population structurée en âge à la fois dans le cas asexué\, et dans le cas sexué. Je me focaliserai sur la sélection d'un taux de mortalité minimal en fonction de la classe d'âge\, dans un en vironnement changeant. En explorant la limite d'échelle des mutations rare s et petites\, nous sommes en mesure de démontrer des phénomènes de seuil dans la dynamique asymptotique du système\, confirmant ainsi des résultats numériques obtenus par Cotto et Ronce sur un modèle discret. En particuli er\, nous démontrons un phénomène de "\;wall of death"\; : au-delà d'une certaine vitesse critique de changement de l'environnement\, les in dividus dans des classes d'âge élevé ne sont plus capables de s'adapter au changement\, et voient leur taux de mortalité croître indéfiniment.\n\nCe ci est un travail commun avec Emeric Bouin (ENS de Lyon)\, Jimmy Garnier ( LAMA\, Chambéry)\, et Thomas Lepoutre (INRIA et ICJ\, Lyon) pour la partie mathématique\, et Olivier Cotto et Ophélie Ronce (ISEM Montpellier) pour la partie modélisation. DTSTART:20150612T150000 DTEND:20150612T160000 LOCATION:Salle B405\, bâtiment B\, LAGA\, Institut Galilée\, Université Par is 13GGé SUMMARY:Quelques résultats quantitatifs pour l'évolution des populations st ructurées en âge. END:VEVENT BEGIN:VEVENT UID:20230626T154011CEST-8617O0NvJ3@mb-1.laga.fr DTSTAMP:20230626T134011Z CATEGORIES:SEMINAIRE MB DESCRIPTION:Ophélie Ronce\n Le vieillissement et le déclin des performances qui l'accompagnent est observé chez des organismes très différents. Cepen dant\, les patrons et la vitesse du vieillissement varient fortement entr e organismes\, et même au sein d'une espèce\, avec notamment l'existence d e génotypes rares particulièrement longévifs. Le vieillissement peut donc apparaître comme un paradoxe évolutif. A partir des années 60\, des outils formels ont été développés permettant de résoudre ce paradoxe évolutif\, expliquant les phénomènes de vieillissement par le déclin de la force de l a sélection avec l'âge des individus. Ces développements théoriques sur le vieillissement ont néanmoins largement ignoré le fait que les populations doivent s'adapter à des environnements changeants dans le temps et l'espa ce. Les changements globaux (changement climatique\, fragmentation des hab itats naturels\, pollution) ont ravivé l'intérêt à modéliser l'adaptation à ces environnements variables\, mais ces derniers modèles ignorent le fai t que les populations soient composées d'individus d'âges différents. Nous avons développé\, en nous basant sur des travaux récents de Barfield et a l. (2011)\, des modèles d'adaptation pour des populations structurées en â ge soumises à des pressions de sélection variables. Ces modèles prédisent l'évolution de patrons de vieillissement plus rapide dans les environnemen ts variables dans le temps et l'espace et permettent de comprendre quels t raits des organismes s'adaptent plus rapidement lorsque l'environnement ch ange. DTSTART:20150612T140000 DTEND:20150612T150000 LOCATION:Salle B405\, bâtiment B\, LAGA\, Institut Galilée\, Université Par is 13GGé SUMMARY:Évolution du vieillissement et adaptation END:VEVENT BEGIN:VEVENT UID:20230626T154011CEST-8837uW49dm@mb-1.laga.fr DTSTAMP:20230626T134011Z CATEGORIES:SEMINAIRE MB DESCRIPTION:Hervé Le Meur\n DTSTART:20150417T144500 DTEND:20150417T154500 LOCATION:Salle B405\, bâtiment B\, LAGA\, Institut Galilée\, Université Par is 13GGé SUMMARY:From mathematical modeling of HIV multiplication to identifiability END:VEVENT BEGIN:VEVENT UID:20230626T154011CEST-8852mDkoXp@mb-1.laga.fr DTSTAMP:20230626T134011Z CATEGORIES:SEMINAIRE MB DESCRIPTION:Claude Reiss Chacun connait les bienfaits des antibiotiques\, q ui sont\, depuis plus de 70 ans\, efficacement et (trop ?) abondamment ut ilisés contre les maladies bactériennes. Mais les antibiotiques sont ineff icaces contre des virus\, contre lesquels il faut des antiviraux. Il en ex iste contre VIH (SIDA) et VHB (hépatite\, cancer du foie)\, efficaces mais n’éliminant pas la virémie\, avec\, contre le VIH des effets secondaires importants et l’obligation d’y recourir à vie. Nous avons développé au CNR S dans les années 90 une famille d’antiviraux (des analogues nucléotidique s)\, qui ont prouvé leurs efficacités contre le VIH in vitro mais pour le squels les essais cliniques n’ont pas encore pu être réalisés\, par manque de moyens. Cette situation a évolué favorablement depuis un an\, puisqu’ il existe actuellement un analogue nucléotidique médicament miracle contre l’hépatite due au VHC. Cette découverte a mis en évidence le potentiel de s analogues nucléotidiques contre les maladies virales en général.\n Depui s plus de 20 ans\, d’importants progrès thérapeutiques ont été faits grâce aux études mathématiques de la dynamique virale au niveau cellulaire. Les objectifs ont été de réduire la durée des traitements antiviraux\, d’en a ugmenter l’efficacité\, d’optimiser les thérapies\, d’en dégager les param ètres viraux cruciaux\, de comprendre la cinétique virale et d’améliorer m édicaments et soins en conséquence. \n La dynamique virale contre le VIH e st malheureusement plus compliquée que celle de la simple relation proie-p rédateur. En effet\, ce virus attaque nos globules blancs et change à chaq ue génération ses caractères antigéniques\, forçant le système immunitaire à développer\, en réponse à chaque génération virale\, une nouvelle armée de globules blancs. De plus\, la prolifération de ces derniers va offrir autant de cibles aux virus\, qui vont se multiplier en conséquence. Le c ycle de production virale durant moins d’une journée\, celui de la product ion de nouveaux globules blancs pour y répondre demandant au moins 3 jours \, le système immunitaire va rapidement s’effondrer : c’est l’immunodéfici ence. \n Nous sommes donc en présence d’un virus qui attaque son prédateur et l’oblige à se multiplier\, ce qui multiplie aussi la population virale \, et d’un système immunitaire qui est en permanence obligé de renouveler son armée de globules blancs pour essayer d’endiguer des vagues de plus e n plus importantes de virus pathogènes. Hervé Le Meur va présenter la mise en équation de cette dynamique. DTSTART:20150417T140000 DTEND:20150417T150000 LOCATION:Salle B405\, bâtiment B\, LAGA\, Institut Galilée\, Université Par is 13GGé SUMMARY:Dynamique antivirale : cas du virus du SIDA. END:VEVENT BEGIN:VEVENT UID:20230626T154012CEST-0261MRrIcj@mb-1.laga.fr DTSTAMP:20230626T134012Z CATEGORIES:SEMINAIRE MB DESCRIPTION:Thierry Colin Nous présenterons un modèles pour décrire la répo nse à deux type de traitements pour des métastases de gist et nous expliqu erons pourquoi\nil est indispensable d’utiliser des données fonctionnelles afin d’obtenir des renseignements pronostiques.\n DTSTART:20150116T153000 DTEND:20150116T160000 LOCATION:Salle B405\, bâtiment B\, LAGA\, Institut Galilée\, Université Par is 13GGé SUMMARY:Un exemple de modélisation: les métastases hépatiques de GIST END:VEVENT BEGIN:VEVENT UID:20230626T154012CEST-0268ghUadz@mb-1.laga.fr DTSTAMP:20230626T134012Z CATEGORIES:SEMINAIRE MB DESCRIPTION:François Cornelis L’imagerie fonctionnelle permet d’aller au de là de la description purement morphologique des tumeurs et devrait permett re\nde mieux adapter les traitements à la pathologie du patient en particu lier dans le cas de thérapies ciblés qui modifient\nsubstantiellement le m étabolisme tumoral. Nous montrerons que l’interprétation des données néces site la mise au point\nde modèles adaptés à chaque pathologie et à chaque patient. DTSTART:20150116T150000 DTEND:20150116T153000 LOCATION:Salle B405\, bâtiment B\, LAGA\, Institut Galilée\, Université Par is 13GGé SUMMARY:Imagerie fonctionnelle et radiologie diagnostiques END:VEVENT BEGIN:VEVENT UID:20230626T154012CEST-0275sF2eEU@mb-1.laga.fr DTSTAMP:20230626T134012Z CATEGORIES:SEMINAIRE MB DESCRIPTION:Thierry Colin Nous présenterons un modèles de croissance de mét astases personnalisé basé sur l’imagerie susceptible d’apporter une aide à la décision\navant de pratiquer une ablation par radiofréquence. DTSTART:20150116T143000 DTEND:20150116T150000 LOCATION:Salle B405\, bâtiment B\, LAGA\, Institut Galilée\, Université Par is 13GGé SUMMARY:Modélisation de la croissance de métastases pulmonaires END:VEVENT BEGIN:VEVENT UID:20230626T154012CEST-0290WlJ7wp@mb-1.laga.fr DTSTAMP:20230626T134012Z CATEGORIES:SEMINAIRE MB DESCRIPTION:François Cornelis Nous présenterons les différentes techniques mini-invasives d’ablation de tumeurs: cryoablation\, électroporation radio -fréquence\nainsi que les indications thérapeutiques de ces techniques. DTSTART:20150116T140000 DTEND:20150116T143000 LOCATION:Salle B405\, bâtiment B\, LAGA\, Institut Galilée\, Université Par is 13GGé SUMMARY:Radiologie interventionnelle END:VEVENT BEGIN:VEVENT UID:20230626T154012CEST-0531221FlG@mb-1.laga.fr DTSTAMP:20230626T134012Z CATEGORIES:SEMINAIRE MB DESCRIPTION:Ian Morilla Determining the network of physical protein associa tions is an important first step in\ndeveloping mechanistic evidence for e lucidating biological pathways in complex systems and \ndiseases. Despite rapid advances in the field of high throughput experiments to determine \n protein interactions\, the majority of associations remain unknown. Here w e describe\ncomputational methods for significantly expanding protein asso ciation networks. We describe \nmathematical methods for integrating multi ple independent sources of evidence to obtain \nhigher quality predictions required for cell functions and needed to focus RNAi screens \nfrom the w hole genome (leveraging both DNA and RNA-seq data) to the most likely cand idates\; \nas assay complexity and cost make genome-scale knockdown experi ments impossible. \nA straight application of these strategies occurs\, fo r instance\, translating this novel\ngenetic knowledge into personalized m edicine for treating complex diseases. \n\n DTSTART:20141128T140000 DTEND:20141128T150000 LOCATION:Salle B405\, bâtiment B\, LAGA\, Institut Galilée\, Université Par is 13GGé SUMMARY:Computational prediction of functional relationships in systems bio logy END:VEVENT BEGIN:VEVENT UID:20230626T154012CEST-0994caLNHR@mb-1.laga.fr DTSTAMP:20230626T134012Z CATEGORIES:SEMINAIRE MB DESCRIPTION:Guillemette Chapuisat\n Dans cet exposé\, je présenterai un mod èle de croissance de tumeur avec prise en compte de l'angiogénèse. Ce modè le mathématique permet de simuler l'effet anti-angiogénique de différents traitement anti-cancéreux et permet de mieux comprendre l'efficacité de ce rtains traitements métronomiques par rapport aux traitements classiques. DTSTART:20140613T150000 DTEND:20140613T160000 LOCATION:Salle B405\, bâtiment B\, LAGA\, Institut Galilée\, Université Par is 13GGé SUMMARY:Modélisation de la croissance d'une tumeur vascularisée et optimisa tion de traitement END:VEVENT BEGIN:VEVENT UID:20230626T154012CEST-1009crk4Sv@mb-1.laga.fr DTSTAMP:20230626T134012Z CATEGORIES:SEMINAIRE MB DESCRIPTION:Nicolas André Since its inception in 2000\, metronomic chemothe rapy has undergone major advances as an anti-angiogenic therapy. The disco very of the pro-immune properties of chemotherapy and its direct effects o n cancer cells has established the intrinsic multi-targeted nature of this therapeutic approach. The past 10 years have seen a marked increase in cl inical trials of metronomic chemotherapy\, and it is increasingly combined in the clinic with conventional treatments\, such as maximum-tolerated do se chemotherapy and radiotherapy\, as well as with novel therapeutic strat egies\, such as drug repositioning\, targeted agents and immunotherapy. We review the recent advances in understanding the complex mechanisms of act ion of metronomic chemotherapy\, and the recently identified factors assoc iated with disease resistance. We comprehensively discuss the latest clini cal data obtained from studies performed in both adult and paediatric popu lations\, and highlight ongoing clinical trials. foresee the future devel opments of metronomic chemotherapy and in particular its potential role in the upcoming era of personalized medicine.\n DTSTART:20140613T140000 DTEND:20140613T150000 LOCATION:Salle B405\, bâtiment B\, LAGA\, Institut Galilée\, Université Par is 13GGé SUMMARY:Metronomics—towards personalized chemotherapy? END:VEVENT BEGIN:VEVENT UID:20230626T154012CEST-1350WmU0gf@mb-1.laga.fr DTSTAMP:20230626T134012Z CATEGORIES:SEMINAIRE MB DESCRIPTION:Delphine Salort\n Cet exposé porte sur l'étude d'une population de neurones ayant une activité spontanée et excitatrice. L'objet est de c omprendre d'un point de vue théorique l'impact de la force des interconnex ions entre les neurones dans l'apparition de décharges rythmées et synchro nisées. Le modèle utilisé est une équation structurée en âge avec fragment ation sur la répartition des périodes réfractaires des neurones après qu'i ls aient déchargé. On montre que la solution tend vers un état stationnair e lorsque les interconnections sont suffisamment faibles\, ce qui correspo nd à un état totalement désynchronisé des neurones. Ensuite on décrit des régimes intermédiaires où l'on construit explicitement plusieurs classes d e solutions périodiques qui traduisent l'apparition de rythmes synchronisé s au sein des neurones. Ces travaux font l'objet d'une collaboration avec K. Pakdaman et B. Perthame. DTSTART:20140328T151500 DTEND:20140328T161500 LOCATION:Salle B405\, bâtiment B\, LAGA\, Institut Galilée\, Université Par is 13GGé SUMMARY:Phénomènes de synchronisation/désynchronisation pour des modèles de réseaux de neurones structurés avec fragmentation II END:VEVENT BEGIN:VEVENT UID:20230626T154012CEST-1371MLBp95@mb-1.laga.fr DTSTAMP:20230626T134012Z CATEGORIES:SEMINAIRE MB DESCRIPTION:Khashayar Pakdaman\n Cet exposé porte sur l'étude d'une populat ion de neurones ayant une activité spontanée et excitatrice. L'objet est d e comprendre d'un point de vue théorique l'impact de la force des intercon nexions entre les neurones dans l'apparition de décharges rythmées et sync hronisées. Le modèle utilisé est une équation structurée en âge avec fragm entation sur la répartition des périodes réfractaires des neurones après q u'ils aient déchargé. On montre que la solution tend vers un état stationn aire lorsque les interconnections sont suffisamment faibles\, ce qui corre spond à un état totalement désynchronisé des neurones. Ensuite on décrit d es régimes intermédiaires où l'on construit explicitement plusieurs classe s de solutions périodiques qui traduisent l'apparition de rythmes synchron isés au sein des neurones. Ces travaux font l'objet d'une collaboration av ec B. Perthame et D. Salort. DTSTART:20140328T140000 DTEND:20140328T150000 LOCATION:Salle B405\, bâtiment B\, LAGA\, Institut Galilée\, Université Par is 13GGé SUMMARY:Phénomènes de synchronisation/désynchronisation pour des modèles de réseaux de neurones structurés avec fragmentation I END:VEVENT BEGIN:VEVENT UID:20230626T154012CEST-3577t0Kt1D@mb-1.laga.fr DTSTAMP:20230626T134012Z CATEGORIES:SEMINAIRE MB DESCRIPTION:Nicolas Bacaer\n L'exposé présentera des travaux effectués depu is quelques années sur la modélisation mathématique des épidémies tenant c ompte de l'influence périodique des saisons ou de fluctuations aléatoires de l'environnement. Les résultats présentent également un certain intérêt pour d'autres sujets liés à la dynamique des populations\, tels que l'écol ogie. Il sera question d'équations aux dérivées partielles\, de théorie sp ectrale\, et de processus stochastiques de naissance et de mort. On essaye ra d'expliquer comment les travaux ont été motivés par des épidémies réell es\, telles que la leishmaniose au Maroc\, le chikungunya à la Réunion\, o u la rougeole en France. DTSTART:20130517T140000 DTEND:20130517T160000 LOCATION:Salle B405\, bâtiment B\, LAGA\, Institut Galilée\, Université Par is 13GGé SUMMARY:Dynamique des populations en environnement périodique ou aléatoire END:VEVENT BEGIN:VEVENT UID:20230626T154012CEST-3886uLJedx@mb-1.laga.fr DTSTAMP:20230626T134012Z CATEGORIES:SEMINAIRE MB DESCRIPTION:Alessandra Carbone Given a family of protein sequences and the associated distance tree\,\nwe shall explain how to predict important info rmation on protein binding sites and on mechanical and allosteric properti es by using a fine reading of the conservation and co-evolution signals be tween residues in the sequences. This information is encoded in the tree t opology. We shall present two methods\, one applicable to protein families of variable divergence and the other to very conserved protein families. DTSTART:20130301T150000 DTEND:20130301T170000 LOCATION:Salle B405\, bâtiment B\, LAGA\, Institut Galilée\, Université Par is 13GGé SUMMARY:Combinatorial methods to extract co-evolution signals among residue s in proteins END:VEVENT BEGIN:VEVENT UID:20230626T154012CEST-3908rOEEvc@mb-1.laga.fr DTSTAMP:20230626T134012Z CATEGORIES:SEMINAIRE MB DESCRIPTION:Elodie Laine\n Une mutation génétique\, une modification biochi mique ou la fixation d'un ligand sont autant de perturbations dont les eff ets peuvent se propager à longue distance entre deux sites d'une protéine. Dans ce travail\, une méthode est proposée\, basée sur les corrélations d ynamiques inter-résidus pour localiser et visualiser des réseaux et canaux de communication à travers les structures protéiques. Nous présentons une application de cette méthode à l'étude de la mutation D816V du récepteur tyrosine kinase KIT. DTSTART:20130301T000000 DTEND:20130301T020000 LOCATION:Salle B405\, bâtiment B\, LAGA\, Institut Galilée\, Université Par is 13GGé SUMMARY:Méthodes de modélisation moléculaire pour extraire des réseaux fonc tionnels de résidus dans les protéines END:VEVENT END:VCALENDAR