Ovipares comme de nombreux autres reptiles, les crocodiles pondent de 20 à 90 œufs par couvée, qu'ils enterrent dans du sable ou sous des végétaux en décomposition. L'incubation des œufs (grâce à la décomposition de la végétation qui a servi à la construction du nid en surface) prend plus de trois mois, à l'issue de laquelle la mère, alertée par les petits cris que poussent les jeunes, les dégage des matériaux qui les recouvrent.
Chez tous les crocodiles, la fécondation est interne grâce à la présence chez le mâle d'un organe copulateur. Les premiers stades de leur cycle vital ne dépendant pas de l'eau, cette caractéristique a permis aux crocodiles de s'affranchir totalement du milieu aquatique pour leur reproduction. La mortalité des jeunes crocodiles est particulièrement élevée : 95 sur 100 n'atteindront pas l'âge adulte. La maturité sexuelle se situe entre 8 et 12 ans.

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